More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3254 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  56.58 
 
 		 782 aa  867    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  47.74 
 
 		 792 aa  716    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  57.33 
 
 		 782 aa  892    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  55.61 
 
 		 835 aa  865    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  56.71 
 
 		 782 aa  870    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  56.14 
 
 		 832 aa  878    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  56.51 
 
 		 900 aa  879    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  56.83 
 
 		 782 aa  881    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  56.58 
 
 		 782 aa  869    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 787 aa  1626    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  41.05 
 
 		 783 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 		 779 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  39.12 
 
 		 889 aa  452  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  39.34 
 
 		 822 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  38.61 
 
 		 897 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 		 911 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  36.77 
 
 		 771 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  35.98 
 
 		 1197 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  27.87 
 
 		 968 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  28.93 
 
 		 1284 aa  237  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  28.61 
 
 		 901 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  28.3 
 
 		 975 aa  222  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  25.71 
 
 		 846 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  27.4 
 
 		 952 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  28.26 
 
 		 1284 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0164  Rhs element Vgr protein  55.05 
 
 		 211 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000065374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  27.43 
 
 		 886 aa  212  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  26.84 
 
 		 690 aa  210  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  27.37 
 
 		 837 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1019 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  27.68 
 
 		 885 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  27.77 
 
 		 918 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.82 
 
 		 869 aa  204  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.51 
 
 		 842 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 843 aa  202  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.49 
 
 		 871 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  26.78 
 
 		 845 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  26.5 
 
 		 924 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  32.46 
 
 		 875 aa  195  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  26.47 
 
 		 822 aa  194  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0809  hypothetical protein  55.81 
 
 		 170 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.47 
 
 		 920 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.68 
 
 		 845 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  23.49 
 
 		 941 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  25.98 
 
 		 826 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  24.88 
 
 		 843 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  26.91 
 
 		 1048 aa  174  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  25.93 
 
 		 835 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.41 
 
 		 910 aa  171  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 1007 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 1007 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  30.26 
 
 		 680 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 1007 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1680  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 1007 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 1007 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0737  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 1007 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0611  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 1007 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0583244  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  25.38 
 
 		 889 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  30.08 
 
 		 680 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  23.76 
 
 		 912 aa  164  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  24.64 
 
 		 843 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1019 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  29.41 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  26.28 
 
 		 840 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  25.68 
 
 		 1041 aa  157  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  29.11 
 
 		 671 aa  157  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  26.64 
 
 		 1207 aa  157  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  28.32 
 
 		 958 aa  154  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  27.9 
 
 		 694 aa  154  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  27.36 
 
 		 1012 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  27.26 
 
 		 702 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  29.66 
 
 		 853 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  28.34 
 
 		 892 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  27.85 
 
 		 741 aa  151  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  25.65 
 
 		 862 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  26.73 
 
 		 684 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  27.31 
 
 		 693 aa  150  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  24.84 
 
 		 862 aa  150  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  27.82 
 
 		 1074 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  24.26 
 
 		 838 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  27.34 
 
 		 852 aa  149  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  23 
 
 		 841 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  23 
 
 		 841 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.07 
 
 		 1063 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.07 
 
 		 1063 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.07 
 
 		 1063 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 		 680 aa  147  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  26.31 
 
 		 808 aa  147  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  27.57 
 
 		 1059 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 1057 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 1057 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  26.31 
 
 		 688 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  28.25 
 
 		 790 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  27.07 
 
 		 853 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  27.37 
 
 		 675 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  27.1 
 
 		 680 aa  145  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  27.55 
 
 		 689 aa  144  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  26.08 
 
 		 841 aa  144  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  27.53 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  27.23 
 
 		 868 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>