More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0733 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  57.33 
 
 		 787 aa  892    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  93.48 
 
 		 782 aa  1506    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  69.45 
 
 		 835 aa  1085    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  94.12 
 
 		 782 aa  1517    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  95.65 
 
 		 782 aa  1556    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  92.54 
 
 		 900 aa  1472    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  100 
 
 		 782 aa  1622    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  94.65 
 
 		 832 aa  1487    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  92.97 
 
 		 782 aa  1496    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  61.1 
 
 		 792 aa  928    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  42.31 
 
 		 783 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  40 
 
 		 822 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  37.21 
 
 		 779 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  39.22 
 
 		 889 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  38.6 
 
 		 897 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 		 911 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 		 771 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  35.38 
 
 		 1197 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0164  Rhs element Vgr protein  85.31 
 
 		 211 aa  364  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000065374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0809  hypothetical protein  88.17 
 
 		 170 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1019 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1019 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  27.18 
 
 		 968 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  28.66 
 
 		 842 aa  244  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  26.04 
 
 		 871 aa  238  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  25.99 
 
 		 869 aa  233  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 1284 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  25.58 
 
 		 875 aa  228  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.62 
 
 		 901 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  26.04 
 
 		 975 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  25.84 
 
 		 886 aa  223  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  26.06 
 
 		 1284 aa  217  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  27.11 
 
 		 826 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  27.38 
 
 		 837 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  27.81 
 
 		 885 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  26.7 
 
 		 690 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  27.86 
 
 		 918 aa  210  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  26.32 
 
 		 822 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  26.21 
 
 		 845 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  27.12 
 
 		 952 aa  204  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.09 
 
 		 843 aa  204  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.82 
 
 		 845 aa  198  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.47 
 
 		 920 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  24.3 
 
 		 846 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  26.78 
 
 		 853 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  26.79 
 
 		 850 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.27 
 
 		 843 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  26.79 
 
 		 850 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  25.68 
 
 		 1063 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  26.79 
 
 		 850 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  25.68 
 
 		 1063 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  25.55 
 
 		 1063 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  25.55 
 
 		 958 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  24.16 
 
 		 923 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  24.27 
 
 		 1048 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  24.58 
 
 		 843 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  25.43 
 
 		 1057 aa  187  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  24.94 
 
 		 1059 aa  187  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  25.56 
 
 		 1057 aa  187  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  26.27 
 
 		 941 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  23.28 
 
 		 853 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 835 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  24.75 
 
 		 862 aa  184  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  25.31 
 
 		 924 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 		 1041 aa  181  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  24.11 
 
 		 852 aa  180  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.19 
 
 		 895 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  24.2 
 
 		 853 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  23.91 
 
 		 892 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  23.23 
 
 		 895 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  24.74 
 
 		 955 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  24.64 
 
 		 956 aa  177  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  24.64 
 
 		 956 aa  177  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  25.31 
 
 		 838 aa  177  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  24.72 
 
 		 862 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  23.69 
 
 		 895 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  25.87 
 
 		 889 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  23.69 
 
 		 895 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 891 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  30.74 
 
 		 671 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  23.78 
 
 		 850 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  23.87 
 
 		 910 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  25.49 
 
 		 851 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  25.54 
 
 		 841 aa  172  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  25.54 
 
 		 841 aa  171  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  23.77 
 
 		 853 aa  171  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  24.57 
 
 		 898 aa  170  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  25.9 
 
 		 933 aa  170  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  24 
 
 		 868 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  23.76 
 
 		 840 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.51 
 
 		 1074 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 		 1207 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  25.06 
 
 		 912 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  27.9 
 
 		 684 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3220  putative VGR-related protein  28.6 
 
 		 509 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  28.65 
 
 		 763 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  28.6 
 
 		 1012 aa  165  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  28.82 
 
 		 1007 aa  164  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  27.74 
 
 		 680 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  29.02 
 
 		 1007 aa  163  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>