More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0454 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  49.85 
 
 		 680 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  51.48 
 
 		 675 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  54.75 
 
 		 763 aa  713    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  58.94 
 
 		 678 aa  762    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  58.24 
 
 		 680 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  52.05 
 
 		 694 aa  700    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  49.78 
 
 		 689 aa  651    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 671 aa  1383    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  58.24 
 
 		 680 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  53.7 
 
 		 684 aa  728    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  59.84 
 
 		 741 aa  745    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  56.59 
 
 		 693 aa  761    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  49.86 
 
 		 691 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  58.24 
 
 		 702 aa  772    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  58.11 
 
 		 808 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  55.9 
 
 		 688 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  59.5 
 
 		 680 aa  810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  56.01 
 
 		 790 aa  703    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  58.09 
 
 		 680 aa  786    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  51.47 
 
 		 675 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  57.34 
 
 		 968 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  48.81 
 
 		 1118 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  36.4 
 
 		 687 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  36.4 
 
 		 687 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  36.4 
 
 		 687 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  33 
 
 		 694 aa  359  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  35.22 
 
 		 656 aa  357  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 		 706 aa  357  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  36.75 
 
 		 741 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 		 723 aa  355  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  37.25 
 
 		 741 aa  355  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  33.29 
 
 		 694 aa  352  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  37.01 
 
 		 609 aa  352  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  35.48 
 
 		 655 aa  350  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  36.62 
 
 		 727 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  33.43 
 
 		 1095 aa  347  4e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  35.54 
 
 		 615 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  36.77 
 
 		 740 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  34.63 
 
 		 618 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  33.83 
 
 		 682 aa  344  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  35.12 
 
 		 617 aa  343  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  36.42 
 
 		 619 aa  343  8e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  32.64 
 
 		 1017 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  36.52 
 
 		 616 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  36.74 
 
 		 740 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  34.48 
 
 		 655 aa  340  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  31.89 
 
 		 771 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  35.46 
 
 		 617 aa  339  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  32.49 
 
 		 699 aa  339  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 678 aa  339  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  35.13 
 
 		 617 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  30.79 
 
 		 692 aa  336  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  31.76 
 
 		 754 aa  336  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  31.78 
 
 		 709 aa  336  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  33.63 
 
 		 678 aa  334  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  32.92 
 
 		 683 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.12 
 
 		 683 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  29.63 
 
 		 754 aa  330  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  38.64 
 
 		 732 aa  330  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  36.33 
 
 		 617 aa  330  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  35.24 
 
 		 697 aa  329  9e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  34.24 
 
 		 706 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  32.44 
 
 		 692 aa  324  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  33.9 
 
 		 610 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  36.23 
 
 		 706 aa  320  5e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  32.69 
 
 		 722 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  33.77 
 
 		 722 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  34.54 
 
 		 725 aa  313  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 		 722 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  34.02 
 
 		 668 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  32.91 
 
 		 618 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.06 
 
 		 756 aa  310  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  33.28 
 
 		 668 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  32.75 
 
 		 726 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  32.72 
 
 		 774 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.98 
 
 		 748 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  31.85 
 
 		 725 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  33.39 
 
 		 778 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  33.22 
 
 		 794 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  32.92 
 
 		 730 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 668 aa  304  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  34.04 
 
 		 572 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  34.66 
 
 		 669 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  31.99 
 
 		 741 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  31.7 
 
 		 725 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  32.64 
 
 		 788 aa  303  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  31.99 
 
 		 741 aa  303  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  32.29 
 
 		 697 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  32.12 
 
 		 907 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  32.52 
 
 		 755 aa  301  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  31.85 
 
 		 692 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  32.23 
 
 		 767 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  32.08 
 
 		 767 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  32.27 
 
 		 785 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  34.45 
 
 		 646 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  33.12 
 
 		 780 aa  293  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  33.68 
 
 		 792 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  31.62 
 
 		 616 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  33.39 
 
 		 643 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  34.23 
 
 		 783 aa  289  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>