232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1968 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 415 aa  868    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  63.75 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  58.29 
 
 		 412 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  42.11 
 
 		 415 aa  276  7e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  37.11 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  36.87 
 
 		 417 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  36.91 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  36.94 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  35.42 
 
 		 430 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  34.13 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  34.62 
 
 		 444 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  33.71 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  30.47 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  29.18 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  30.89 
 
 		 430 aa  162  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 431 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  29.13 
 
 		 431 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  30.73 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  30.89 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  28.87 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 431 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  30 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  30.87 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  30.59 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.19 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  31.46 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  32.07 
 
 		 420 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  31.1 
 
 		 428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  29.72 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  29.72 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  29.72 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  29.72 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  28.37 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  27.42 
 
 		 716 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  27.32 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  30.32 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  30.32 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  30.85 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  29.97 
 
 		 394 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  25.83 
 
 		 704 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  25.83 
 
 		 704 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  27.75 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  28.34 
 
 		 770 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  26.65 
 
 		 417 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 565 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  25.49 
 
 		 397 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  25.76 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  25.2 
 
 		 575 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  24.93 
 
 		 566 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  25.27 
 
 		 559 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  26 
 
 		 565 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  26 
 
 		 565 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  26 
 
 		 565 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  26 
 
 		 565 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  24.8 
 
 		 578 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  26.36 
 
 		 566 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  25 
 
 		 578 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 578 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  25 
 
 		 578 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  26 
 
 		 563 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  25.82 
 
 		 580 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  25 
 
 		 578 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  24.8 
 
 		 580 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  25.75 
 
 		 557 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  25.34 
 
 		 588 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  26.52 
 
 		 630 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  24.04 
 
 		 376 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 559 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  24.52 
 
 		 565 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  24.52 
 
 		 565 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  25.34 
 
 		 563 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  25.28 
 
 		 490 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  23.48 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  23.73 
 
 		 508 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  24.57 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  23.28 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 624 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  25.57 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  23.94 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  23.94 
 
 		 559 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  25.48 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  23.41 
 
 		 733 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  25.91 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  31.55 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  23.14 
 
 		 609 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  23.18 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  24.41 
 
 		 797 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  24.67 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  30.43 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  23.63 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  22.77 
 
 		 732 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  34.06 
 
 		 190 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  25.88 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  23.85 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>