130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2002 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  82.09 
 
 		 431 aa  767    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  100 
 
 		 431 aa  904    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  99.77 
 
 		 431 aa  902    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  69.93 
 
 		 435 aa  656    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  95.35 
 
 		 431 aa  862    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  81.16 
 
 		 431 aa  761    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  81.16 
 
 		 431 aa  761    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  81.63 
 
 		 431 aa  765    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  72.56 
 
 		 430 aa  660    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  70.7 
 
 		 430 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  82.33 
 
 		 431 aa  770    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  72.33 
 
 		 430 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  69.59 
 
 		 440 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  64.24 
 
 		 423 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  90.94 
 
 		 288 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2367  hypothetical protein  88.89 
 
 		 146 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  35.41 
 
 		 411 aa  269  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  34.11 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  33.88 
 
 		 406 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  34.51 
 
 		 415 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  30.91 
 
 		 408 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  30.68 
 
 		 408 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  30.99 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  29.6 
 
 		 430 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  29.53 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.89 
 
 		 412 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  28.98 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  26.25 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 418 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  25.73 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  27.07 
 
 		 716 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  25.26 
 
 		 397 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  25.26 
 
 		 397 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  25.26 
 
 		 397 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  25.26 
 
 		 397 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.59 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  25.97 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  23.94 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  24.73 
 
 		 630 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  24.1 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  24.18 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  24.16 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  24.09 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  24.54 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  23.04 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  22.9 
 
 		 704 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  22.9 
 
 		 704 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  23.96 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  23.96 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  23.5 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  24.83 
 
 		 770 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.09 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  24.53 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  25 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  23.2 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  25 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  23.75 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  24.66 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  23.37 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  24.58 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  22.76 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25.64 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  24.75 
 
 		 557 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  21.74 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  23.18 
 
 		 580 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  23.18 
 
 		 578 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 191 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  22.85 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  23.18 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  23.54 
 
 		 733 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  25.7 
 
 		 294 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  22.45 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  22.45 
 
 		 578 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  23.67 
 
 		 413 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  22.92 
 
 		 578 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  20.66 
 
 		 527 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  23.86 
 
 		 508 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  23.71 
 
 		 565 aa  53.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  23.71 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.99 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  22.66 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  22.46 
 
 		 588 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  29.73 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  23.51 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.94 
 
 		 320 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  21.47 
 
 		 559 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  23.42 
 
 		 317 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.05 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  21.38 
 
 		 609 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.31 
 
 		 290 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>