More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7315 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  100 
 
 		 508 aa  999    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  65.85 
 
 		 490 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  62.42 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  60.81 
 
 		 495 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  49.12 
 
 		 527 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  44.85 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  34.09 
 
 		 411 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  34.97 
 
 		 559 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 417 aa  124  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  31.86 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  32.97 
 
 		 565 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  32.97 
 
 		 565 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  32.97 
 
 		 565 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  32.97 
 
 		 565 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  33.15 
 
 		 563 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  30.72 
 
 		 704 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  31.96 
 
 		 566 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  30.72 
 
 		 704 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  31.77 
 
 		 442 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  31.05 
 
 		 557 aa  114  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  33.05 
 
 		 559 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  30.26 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  33.15 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  31.92 
 
 		 420 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  33.05 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  31.74 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  33.05 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  33.05 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  30.54 
 
 		 565 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  30.54 
 
 		 565 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  31.17 
 
 		 559 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  32.37 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  33.24 
 
 		 580 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  32.16 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  31.32 
 
 		 565 aa  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  31.54 
 
 		 563 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  28.49 
 
 		 716 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  31.68 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  30.88 
 
 		 304 aa  99.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  31.89 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  31.89 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  31.47 
 
 		 588 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  31.89 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  31.89 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  31.17 
 
 		 770 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1772  phage integrase-like protein SAM-like protein  62.22 
 
 		 93 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62021  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  28.44 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  28.75 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.05 
 
 		 299 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  28.03 
 
 		 732 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  31.23 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  31.23 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.44 
 
 		 332 aa  92.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  30.08 
 
 		 578 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 282 aa  91.3  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  31.65 
 
 		 575 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  27.36 
 
 		 308 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  22.53 
 
 		 296 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.74 
 
 		 299 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  27.83 
 
 		 394 aa  90.1  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  31.51 
 
 		 578 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  29.4 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  30.08 
 
 		 580 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  30.08 
 
 		 578 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 296 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  33.44 
 
 		 298 aa  87.4  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 436 aa  86.7  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.05 
 
 		 294 aa  86.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.14 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  23.73 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.66 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  27.75 
 
 		 734 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  26.23 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.83 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  28.27 
 
 		 294 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  23.69 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  26.77 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  29.82 
 
 		 630 aa  81.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  27.92 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  24.62 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.95 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  29.94 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  27.86 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 559 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  26.56 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.05 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  26.51 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 277 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 318 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  28.22 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 624 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.75 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  29.01 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.82 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  28.06 
 
 		 609 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>