More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1625 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  100 
 
 		 411 aa  830    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  70.36 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  70.36 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  70.36 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  70.36 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  67.96 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  58.13 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  56.85 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  59.08 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  60.1 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  59.08 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  59.08 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  55.72 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  55.22 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  54.26 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  40.65 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  38.5 
 
 		 566 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  38.99 
 
 		 559 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  40.65 
 
 		 578 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  38.96 
 
 		 559 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  40.65 
 
 		 578 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  40.65 
 
 		 578 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  38.3 
 
 		 557 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  39.52 
 
 		 578 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  39.02 
 
 		 565 aa  216  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  40.95 
 
 		 575 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  39.8 
 
 		 578 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  37.85 
 
 		 565 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  37.85 
 
 		 565 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  37.85 
 
 		 565 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  37.85 
 
 		 565 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  40.05 
 
 		 580 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  40.8 
 
 		 580 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  37.31 
 
 		 565 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  37.31 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  37.27 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  37.84 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  37.67 
 
 		 563 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  38.21 
 
 		 559 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  37.2 
 
 		 566 aa  206  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  39.68 
 
 		 588 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  54.1 
 
 		 191 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  38.32 
 
 		 563 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  37.63 
 
 		 566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  36.58 
 
 		 563 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  38.71 
 
 		 507 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  38.71 
 
 		 559 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  39.06 
 
 		 770 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  37.25 
 
 		 630 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  31.54 
 
 		 704 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  31.54 
 
 		 704 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  34.31 
 
 		 733 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  31.01 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  31.01 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  32.05 
 
 		 716 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  36.64 
 
 		 618 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  33.57 
 
 		 710 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  29.88 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  34.02 
 
 		 436 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  53.59 
 
 		 190 aa  156  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  31.27 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  29.04 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  30.69 
 
 		 797 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  34.03 
 
 		 577 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  35.39 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  31.73 
 
 		 618 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  30.19 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  30.52 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  34.12 
 
 		 577 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  29.38 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  29.76 
 
 		 732 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  31.59 
 
 		 624 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  29.51 
 
 		 734 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  33.24 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  34.09 
 
 		 508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  34.8 
 
 		 609 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  33.05 
 
 		 609 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  32.66 
 
 		 495 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  30.33 
 
 		 430 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  46.41 
 
 		 222 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  28.68 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  27.69 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  31.82 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  29.83 
 
 		 527 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  38.67 
 
 		 616 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02236  putative prolin-rich protein  31.65 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.66 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  27.54 
 
 		 411 aa  99.8  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  25.45 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3779  putative proline-rich protein  30.14 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0230018  normal  0.115334 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3891  putative prolin-rich protein  30.14 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  25.53 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 430 aa  93.2  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.31 
 
 		 309 aa  90.5  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>