27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2367 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2367  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  307  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  88.89 
 
 		 431 aa  283  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  88.89 
 
 		 431 aa  283  7e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  88.89 
 
 		 431 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  75.69 
 
 		 431 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  75.69 
 
 		 431 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  74.31 
 
 		 431 aa  246  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  74.31 
 
 		 431 aa  245  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  73.61 
 
 		 431 aa  243  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  69.18 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  63.89 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  64.54 
 
 		 435 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  62.5 
 
 		 430 aa  206  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  63.19 
 
 		 430 aa  204  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  55.04 
 
 		 423 aa  168  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  30.94 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  33.86 
 
 		 406 aa  68.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  33.86 
 
 		 417 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  28.91 
 
 		 408 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  28.12 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  38.96 
 
 		 415 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  31.65 
 
 		 418 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.93 
 
 		 412 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  31.52 
 
 		 444 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  27.59 
 
 		 430 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>