161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1832 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  843    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  98.77 
 
 
408 aa  834    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  61.44 
 
 
406 aa  508  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  61.04 
 
 
417 aa  508  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  51.82 
 
 
415 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  38.92 
 
 
430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  35.66 
 
 
434 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  36.94 
 
 
415 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  35.58 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.79 
 
 
412 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  34.93 
 
 
418 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  33.6 
 
 
431 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  33.6 
 
 
431 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  33.6 
 
 
431 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  31.91 
 
 
423 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  32.28 
 
 
431 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  32.28 
 
 
431 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  32.32 
 
 
435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  30.56 
 
 
430 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  30.91 
 
 
431 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  30.91 
 
 
431 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  30.91 
 
 
431 aa  209  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  30.42 
 
 
430 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  34.74 
 
 
440 aa  203  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  28.64 
 
 
430 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  32.98 
 
 
418 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  31.06 
 
 
411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.01 
 
 
411 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  31.32 
 
 
422 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  32.35 
 
 
397 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  32.35 
 
 
397 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  32.35 
 
 
397 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  32.35 
 
 
397 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 
288 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  30.27 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  28.68 
 
 
420 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  29.47 
 
 
398 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  28.46 
 
 
394 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  29.47 
 
 
398 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  29.47 
 
 
398 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  29.69 
 
 
428 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  30.83 
 
 
399 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  30.03 
 
 
417 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  27.73 
 
 
397 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  27.15 
 
 
716 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  29.17 
 
 
588 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  27.88 
 
 
559 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  26.3 
 
 
565 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  26.3 
 
 
565 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  26.3 
 
 
565 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  26.3 
 
 
565 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  26.58 
 
 
563 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  28.64 
 
 
580 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  24.61 
 
 
376 aa  99.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  26.78 
 
 
563 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  25.6 
 
 
420 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  28.02 
 
 
566 aa  96.7  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  26.67 
 
 
578 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  25.34 
 
 
565 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  25.34 
 
 
565 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  27.53 
 
 
733 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  25.46 
 
 
565 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  26.6 
 
 
580 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  26.41 
 
 
578 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  26.53 
 
 
578 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  26.65 
 
 
578 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  26.65 
 
 
578 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  27.79 
 
 
557 aa  89.7  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  25.7 
 
 
609 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  26.47 
 
 
507 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  26.47 
 
 
559 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  25.07 
 
 
559 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  25.2 
 
 
563 aa  86.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  25.6 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  25.73 
 
 
559 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  27.34 
 
 
575 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  27.85 
 
 
770 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  27.27 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  24.72 
 
 
624 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  34.09 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  24.05 
 
 
704 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  24.05 
 
 
704 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  25.59 
 
 
566 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  25.82 
 
 
566 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  24.69 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  25.72 
 
 
732 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  24.58 
 
 
630 aa  77.8  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  25.23 
 
 
710 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  25.97 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  34.38 
 
 
190 aa  69.3  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  25.97 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  23.84 
 
 
734 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  25.21 
 
 
495 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  24.45 
 
 
797 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  23.57 
 
 
618 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  27.18 
 
 
618 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3779  putative proline-rich protein  23.96 
 
 
427 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0230018  normal  0.115334 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3891  putative prolin-rich protein  23.96 
 
 
427 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  23.73 
 
 
508 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2367  hypothetical protein  28.91 
 
 
146 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>