More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6262 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  100 
 
 		 770 aa  1518    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  37.57 
 
 		 733 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5732  integrase family protein  82.1 
 
 		 274 aa  360  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  36.16 
 
 		 710 aa  324  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  35.64 
 
 		 630 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  38.95 
 
 		 575 aa  265  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  33.58 
 
 		 704 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  33.58 
 
 		 704 aa  263  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  38.61 
 
 		 578 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  37.32 
 
 		 580 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  38.73 
 
 		 588 aa  259  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  39.02 
 
 		 578 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  38.46 
 
 		 578 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  38.82 
 
 		 578 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  39.18 
 
 		 580 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  38.43 
 
 		 578 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  37.7 
 
 		 563 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  37.9 
 
 		 566 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  36.94 
 
 		 565 aa  253  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  38.67 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  37.68 
 
 		 559 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  37.45 
 
 		 559 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  30.64 
 
 		 716 aa  244  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  36.67 
 
 		 565 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  36.67 
 
 		 565 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  36.67 
 
 		 565 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  36.67 
 
 		 565 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  37.55 
 
 		 563 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  36.42 
 
 		 559 aa  231  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  37.35 
 
 		 566 aa  230  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  36.71 
 
 		 563 aa  228  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  35.99 
 
 		 565 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  38.16 
 
 		 442 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  35.79 
 
 		 565 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  35.88 
 
 		 577 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  35.52 
 
 		 577 aa  221  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  36.68 
 
 		 559 aa  221  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  36.68 
 
 		 507 aa  220  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  34.74 
 
 		 566 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  38.6 
 
 		 422 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  39.06 
 
 		 411 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  38.19 
 
 		 421 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  39.9 
 
 		 420 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  30.35 
 
 		 732 aa  193  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  30.32 
 
 		 734 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  40.41 
 
 		 428 aa  190  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  38.63 
 
 		 397 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  38.63 
 
 		 397 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  38.63 
 
 		 397 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  38.63 
 
 		 397 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  40.1 
 
 		 398 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  33.03 
 
 		 609 aa  187  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  39.84 
 
 		 398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  39.84 
 
 		 398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  39.95 
 
 		 399 aa  183  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  36.36 
 
 		 394 aa  180  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.79 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  30.97 
 
 		 609 aa  178  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  33.66 
 
 		 618 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  35.82 
 
 		 417 aa  169  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 624 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 618 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  43.48 
 
 		 222 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  36.94 
 
 		 397 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  31.08 
 
 		 420 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  30.64 
 
 		 797 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  34.6 
 
 		 398 aa  132  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  33.51 
 
 		 495 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  28.34 
 
 		 415 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  29.16 
 
 		 436 aa  114  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  31.17 
 
 		 508 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  31.58 
 
 		 495 aa  111  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  26.83 
 
 		 418 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  27.79 
 
 		 376 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  33.2 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 417 aa  102  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  26.54 
 
 		 406 aa  102  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  35.55 
 
 		 527 aa  101  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  29.8 
 
 		 490 aa  100  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  27.85 
 
 		 408 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  27.85 
 
 		 408 aa  99.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  29.03 
 
 		 527 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  28.97 
 
 		 336 aa  96.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 415 aa  94.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  26.54 
 
 		 434 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  29.64 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  29.48 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  35.1 
 
 		 323 aa  86.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  29.15 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  29.35 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  29.54 
 
 		 299 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  29.65 
 
 		 304 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  33.17 
 
 		 298 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 		 299 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 		 299 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  26.76 
 
 		 299 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 300 aa  83.2  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  35.06 
 
 		 365 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  40.86 
 
 		 310 aa  83.2  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.16 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>