More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5567 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  79.4 
 
 		 565 aa  892    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  64.55 
 
 		 565 aa  697    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  65.49 
 
 		 566 aa  703    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  65.23 
 
 		 578 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  82.59 
 
 		 563 aa  923    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  79.4 
 
 		 565 aa  892    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  65.7 
 
 		 575 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  62.17 
 
 		 563 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  63.49 
 
 		 566 aa  712    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  78.87 
 
 		 559 aa  867    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  64.45 
 
 		 578 aa  693    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  79.4 
 
 		 565 aa  892    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  75.09 
 
 		 563 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  64.63 
 
 		 580 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  64.61 
 
 		 559 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  62.94 
 
 		 557 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  79.4 
 
 		 565 aa  892    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  64.66 
 
 		 559 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  65.05 
 
 		 578 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  99.82 
 
 		 565 aa  1124    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  64.94 
 
 		 578 aa  691    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  100 
 
 		 565 aa  1126    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  64.79 
 
 		 566 aa  678    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  64.81 
 
 		 578 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  60.95 
 
 		 559 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  72.95 
 
 		 442 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  62.38 
 
 		 507 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  55.42 
 
 		 580 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  54.95 
 
 		 588 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  34.67 
 
 		 704 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  34.67 
 
 		 704 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  33.03 
 
 		 716 aa  246  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  57.89 
 
 		 222 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  55.22 
 
 		 248 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  35.74 
 
 		 630 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  37.31 
 
 		 411 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  35.79 
 
 		 770 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  32.84 
 
 		 710 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  35.82 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  30.69 
 
 		 733 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  35.11 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  34.35 
 
 		 394 aa  190  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  35.53 
 
 		 398 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  35.53 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  35.53 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  35.26 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  35.16 
 
 		 397 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  35.16 
 
 		 397 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  35.16 
 
 		 397 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  35.16 
 
 		 397 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  33.09 
 
 		 421 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  34.66 
 
 		 428 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  29.49 
 
 		 577 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  35.57 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  29.32 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  54.17 
 
 		 185 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  33.47 
 
 		 618 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  35.06 
 
 		 420 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  33.25 
 
 		 417 aa  167  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 609 aa  156  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  28.88 
 
 		 734 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 609 aa  151  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 618 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 624 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  26.37 
 
 		 732 aa  135  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  35.74 
 
 		 616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  31.9 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  27.96 
 
 		 376 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  26.84 
 
 		 434 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  30.15 
 
 		 526 aa  110  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  30.54 
 
 		 508 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  28.31 
 
 		 527 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  28.61 
 
 		 444 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  31.31 
 
 		 527 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  29.02 
 
 		 495 aa  100  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  31.78 
 
 		 398 aa  100  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  26.79 
 
 		 797 aa  99  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  29.86 
 
 		 495 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  25.34 
 
 		 408 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 417 aa  95.9  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  25.34 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  24.87 
 
 		 406 aa  95.9  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  24.52 
 
 		 415 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  28.96 
 
 		 293 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  25.39 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  23.59 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  30.63 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  29.08 
 
 		 295 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  24.43 
 
 		 307 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  33.7 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.17 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  28.02 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.58 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  32.17 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.55 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>