More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6864 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  64.77 
 
 		 565 aa  696    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  66.37 
 
 		 580 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  67.81 
 
 		 575 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  68.67 
 
 		 566 aa  721    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  66.31 
 
 		 578 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  91.47 
 
 		 565 aa  1017    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  91.47 
 
 		 565 aa  1017    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  63.17 
 
 		 563 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  83.45 
 
 		 559 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  67.52 
 
 		 566 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  66.91 
 
 		 578 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  80.78 
 
 		 563 aa  886    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  91.47 
 
 		 565 aa  1017    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  63.99 
 
 		 557 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  67.58 
 
 		 559 aa  717    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  66.55 
 
 		 578 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  82.42 
 
 		 565 aa  922    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  64.96 
 
 		 566 aa  735    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  91.47 
 
 		 565 aa  1017    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  66.55 
 
 		 578 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  66.73 
 
 		 559 aa  697    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  82.59 
 
 		 565 aa  923    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  66.37 
 
 		 578 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  62.61 
 
 		 559 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  100 
 
 		 563 aa  1105    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  74.32 
 
 		 442 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  64.3 
 
 		 507 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  57.19 
 
 		 580 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  57.37 
 
 		 588 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  35.34 
 
 		 716 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  35.08 
 
 		 704 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  35.08 
 
 		 704 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  61.17 
 
 		 222 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  56.9 
 
 		 248 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  37.7 
 
 		 770 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  35.01 
 
 		 630 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  36.39 
 
 		 422 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  37.67 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  35.96 
 
 		 420 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  33.98 
 
 		 710 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  36.18 
 
 		 394 aa  204  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  35.68 
 
 		 421 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  35.7 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  35.7 
 
 		 398 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  35.7 
 
 		 398 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.73 
 
 		 733 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  36.93 
 
 		 397 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  36.93 
 
 		 397 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  36.93 
 
 		 397 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  36.93 
 
 		 397 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  35.17 
 
 		 428 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  36.02 
 
 		 399 aa  188  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  39.38 
 
 		 397 aa  183  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  57.74 
 
 		 185 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  31.38 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  34.95 
 
 		 417 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  31.21 
 
 		 577 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  33.87 
 
 		 618 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  31.02 
 
 		 734 aa  173  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  33.82 
 
 		 420 aa  173  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  31.18 
 
 		 618 aa  161  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  32.02 
 
 		 609 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  31.14 
 
 		 609 aa  156  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  27.9 
 
 		 732 aa  151  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  38.78 
 
 		 616 aa  146  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  28.69 
 
 		 376 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 436 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  27.51 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  29.49 
 
 		 797 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  33.15 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  33.06 
 
 		 490 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  28.72 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  34.15 
 
 		 398 aa  108  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  29.85 
 
 		 526 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  30.18 
 
 		 527 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  26.58 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  30.9 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  26.58 
 
 		 408 aa  101  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  30.83 
 
 		 495 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  26.7 
 
 		 406 aa  99.8  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  26 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  28.1 
 
 		 527 aa  97.1  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  25.07 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  26.27 
 
 		 430 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  32.92 
 
 		 303 aa  86.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.85 
 
 		 297 aa  83.2  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  34.64 
 
 		 293 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.56 
 
 		 332 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.34 
 
 		 295 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  26.05 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.28 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.81 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  32.22 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1679  phage integrase  70.37 
 
 		 54 aa  77.8  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.493771  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.92 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>