More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5389 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  67.38 
 
 		 565 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  87.93 
 
 		 580 aa  997    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  69.19 
 
 		 566 aa  720    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  66.2 
 
 		 566 aa  689    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  66.49 
 
 		 559 aa  693    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  67.38 
 
 		 565 aa  719    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  65.5 
 
 		 563 aa  693    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  68.41 
 
 		 559 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  100 
 
 		 575 aa  1125    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  88.93 
 
 		 578 aa  999    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  64.65 
 
 		 566 aa  719    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  63.79 
 
 		 563 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  89.1 
 
 		 578 aa  1007    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  67.38 
 
 		 565 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  66.55 
 
 		 565 aa  699    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  67.38 
 
 		 565 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  66.61 
 
 		 559 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  88.75 
 
 		 578 aa  1004    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  65.52 
 
 		 565 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  67.81 
 
 		 563 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  88.58 
 
 		 578 aa  1004    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  65.7 
 
 		 565 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  88.58 
 
 		 578 aa  1002    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  63.55 
 
 		 559 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  63.49 
 
 		 557 aa  626  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  73.48 
 
 		 442 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  64.12 
 
 		 507 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  55.34 
 
 		 580 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  55.34 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  67.8 
 
 		 248 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  34.8 
 
 		 704 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  34.8 
 
 		 704 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  33.58 
 
 		 716 aa  246  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  38.95 
 
 		 770 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  59.09 
 
 		 222 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  40.95 
 
 		 411 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  35.19 
 
 		 630 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  33.27 
 
 		 733 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  37.28 
 
 		 394 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  36.68 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  35.4 
 
 		 422 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  34.3 
 
 		 710 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  36.62 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  36.1 
 
 		 398 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  36.1 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  36.1 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  35.42 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  36.62 
 
 		 428 aa  189  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  36.25 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  31.19 
 
 		 577 aa  180  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  31.02 
 
 		 577 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  35.84 
 
 		 397 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  35.84 
 
 		 397 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  35.84 
 
 		 397 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  35.84 
 
 		 397 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  58.33 
 
 		 185 aa  177  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  33.14 
 
 		 609 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  34.58 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  36.62 
 
 		 397 aa  169  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 618 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 609 aa  163  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  31.37 
 
 		 624 aa  157  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  33.33 
 
 		 616 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  29.63 
 
 		 732 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  29.76 
 
 		 734 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  29.84 
 
 		 376 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  28.79 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  29.59 
 
 		 797 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  33.06 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  28.5 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  30.77 
 
 		 490 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  32.12 
 
 		 527 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  28.25 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 415 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  30.65 
 
 		 526 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 417 aa  98.6  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  26.46 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  32.18 
 
 		 508 aa  94  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  26.78 
 
 		 430 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  24.73 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 415 aa  90.9  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  30.61 
 
 		 296 aa  90.5  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  27.06 
 
 		 408 aa  90.1  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  29.52 
 
 		 317 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  26.7 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  34.24 
 
 		 294 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  29.59 
 
 		 495 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  30.29 
 
 		 295 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  30.56 
 
 		 295 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  37.13 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  29.21 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.52 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  31.42 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.1 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  30.86 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>