More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2777 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  100 
 
 		 420 aa  845    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  38.65 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  38.65 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  38.92 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  38.65 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  39.19 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  36.88 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  36.39 
 
 		 394 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  37.6 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  36.01 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  35.62 
 
 		 422 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  36.57 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  35.84 
 
 		 563 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  35.73 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  35.73 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  35.73 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  35.73 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  34.03 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  36 
 
 		 565 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  36 
 
 		 565 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  36 
 
 		 565 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  36 
 
 		 565 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  35.77 
 
 		 580 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  36.25 
 
 		 559 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  35.1 
 
 		 563 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  35.47 
 
 		 588 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  36.41 
 
 		 565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  36.41 
 
 		 565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  35.59 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  35.51 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  34.08 
 
 		 565 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  33.08 
 
 		 559 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  35.32 
 
 		 575 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  34.98 
 
 		 580 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  35.06 
 
 		 578 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  34.22 
 
 		 578 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  34.73 
 
 		 578 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  33.98 
 
 		 578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  33.98 
 
 		 578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  33.79 
 
 		 563 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  33.07 
 
 		 566 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  32.58 
 
 		 559 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  31.78 
 
 		 557 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  33.84 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  33.84 
 
 		 559 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  32.8 
 
 		 566 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  28.37 
 
 		 704 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  28.37 
 
 		 704 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  27.68 
 
 		 716 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  30.28 
 
 		 733 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  30.84 
 
 		 770 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  30.7 
 
 		 710 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  27.4 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  31.98 
 
 		 398 aa  116  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  30.93 
 
 		 630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  39.33 
 
 		 222 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  25.36 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  25.07 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  25.68 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  25.83 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.15 
 
 		 616 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 618 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 609 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  27.2 
 
 		 527 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  31.42 
 
 		 618 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  28.44 
 
 		 508 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  27.82 
 
 		 732 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  28.76 
 
 		 577 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  29.6 
 
 		 490 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 609 aa  94  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  26.82 
 
 		 734 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  28.5 
 
 		 577 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  23.51 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.57 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02236  putative prolin-rich protein  30.24 
 
 		 432 aa  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 624 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  24.15 
 
 		 423 aa  86.7  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  27.47 
 
 		 495 aa  86.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  23.26 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  22.28 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  26.48 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  24.03 
 
 		 797 aa  83.2  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  23.94 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  22.16 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  22.16 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  26.2 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  23.69 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  25.53 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3779  putative proline-rich protein  26.94 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0230018  normal  0.115334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  26.33 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3891  putative prolin-rich protein  26.94 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  27.98 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  22.02 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  23.9 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.05 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>