More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5040 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  100 
 
 		 732 aa  1496    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  83.38 
 
 		 734 aa  1197    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  29.23 
 
 		 704 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  29.23 
 
 		 704 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  29.1 
 
 		 797 aa  195  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  29.53 
 
 		 716 aa  193  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  29.33 
 
 		 630 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  28.06 
 
 		 733 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  30.35 
 
 		 770 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.95 
 
 		 616 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  30 
 
 		 588 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 559 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  30.36 
 
 		 580 aa  157  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  30.36 
 
 		 618 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  26.32 
 
 		 710 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 618 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  27.9 
 
 		 563 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 565 aa  148  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 565 aa  148  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 565 aa  148  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 565 aa  148  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  30.56 
 
 		 422 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  28.98 
 
 		 578 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  29.36 
 
 		 578 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 565 aa  146  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  28.8 
 
 		 580 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  29.02 
 
 		 578 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  29.02 
 
 		 578 aa  144  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  29.45 
 
 		 575 aa  144  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 566 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  30.71 
 
 		 421 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  30.35 
 
 		 428 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  28.57 
 
 		 578 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  30.48 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  29.85 
 
 		 398 aa  138  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  29.78 
 
 		 420 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  29.6 
 
 		 398 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  28.36 
 
 		 559 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  29.6 
 
 		 398 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.76 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  27.6 
 
 		 559 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  27.6 
 
 		 507 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  26.37 
 
 		 565 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 565 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  28.01 
 
 		 566 aa  134  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  26.91 
 
 		 563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  27.96 
 
 		 394 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  28.54 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  28.98 
 
 		 577 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  30.1 
 
 		 442 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  26.64 
 
 		 563 aa  125  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  28.93 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  29.02 
 
 		 397 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  29.02 
 
 		 397 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  29.02 
 
 		 397 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  29.02 
 
 		 397 aa  124  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 417 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  30.38 
 
 		 399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 609 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  26.62 
 
 		 566 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 609 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  22.14 
 
 		 624 aa  106  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  28.03 
 
 		 508 aa  94.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  26.76 
 
 		 420 aa  92.8  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 436 aa  92  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  28.09 
 
 		 527 aa  91.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  26.83 
 
 		 397 aa  90.9  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  28.99 
 
 		 495 aa  89.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  27.7 
 
 		 495 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  29.4 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  36.17 
 
 		 222 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  25.78 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  25.81 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  25.72 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  27.87 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  27.56 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  25.07 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  23.1 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  28.72 
 
 		 495 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  23.1 
 
 		 406 aa  70.5  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0902  integrase family protein  27.39 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  26.76 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  29 
 
 		 339 aa  62  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  22.77 
 
 		 415 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  25.59 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  28.5 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  30.95 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  30.67 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  27.7 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  26.4 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.84 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.79 
 
 		 332 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  27.08 
 
 		 308 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  24.36 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.67 
 
 		 297 aa  59.7  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4624  integrase family protein  28.57 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.00236939 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.16 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  24.5 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.57 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>