133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  100 
 
 		 430 aa  880    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  43.13 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  41.72 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  38.92 
 
 		 408 aa  283  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  38.65 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  38.03 
 
 		 406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  37.77 
 
 		 417 aa  266  7e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  36.87 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  35.42 
 
 		 415 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  36.36 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.94 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  30.88 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  28.93 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  29.68 
 
 		 435 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  30.53 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  28.4 
 
 		 431 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  28.13 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  30.03 
 
 		 430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  27.9 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  27.9 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  32.8 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  29.6 
 
 		 431 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  28.13 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  28.64 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  29.44 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.33 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  31.17 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  30.53 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  27.46 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  29.1 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  29.64 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  29.64 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  29.64 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  29.64 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  28.57 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  28.2 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  28.54 
 
 		 398 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  28.54 
 
 		 398 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  29.64 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  29.06 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  28.2 
 
 		 566 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  28.46 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  28.07 
 
 		 630 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  26.9 
 
 		 716 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  27.04 
 
 		 559 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  26.74 
 
 		 566 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  27.84 
 
 		 588 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  26.91 
 
 		 442 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  27.05 
 
 		 557 aa  93.2  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  26.17 
 
 		 578 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  26.72 
 
 		 578 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 578 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 578 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  27.4 
 
 		 578 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  26.29 
 
 		 580 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  26.55 
 
 		 580 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 565 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 565 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 565 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 565 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  26.36 
 
 		 575 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 563 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  26.4 
 
 		 563 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  24.48 
 
 		 704 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  24.48 
 
 		 704 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  26.33 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 565 aa  83.2  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  25.92 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  25.39 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 565 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  25.67 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  26.21 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  32.28 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  27.79 
 
 		 733 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  25 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  24.06 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  25.88 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  22.14 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  28.34 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  28.57 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  26.02 
 
 		 770 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 609 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  28.46 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  25.54 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.5 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  22.8 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.8 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.12 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.12 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  22.01 
 
 		 624 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  22.92 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  30.06 
 
 		 495 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  23.04 
 
 		 734 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>