More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5548 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  100 
 
 		 527 aa  1079    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  50.4 
 
 		 495 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  49.6 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  49.12 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  46.46 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  38.63 
 
 		 495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  31.03 
 
 		 704 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  31.03 
 
 		 704 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  31.37 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  30.16 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  29.78 
 
 		 578 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  29.78 
 
 		 578 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.83 
 
 		 411 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  29.06 
 
 		 716 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  28.31 
 
 		 565 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  28.31 
 
 		 565 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  28.97 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  28.69 
 
 		 578 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  30.42 
 
 		 565 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  29.41 
 
 		 580 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  28.04 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  29.18 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  29.18 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 565 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 565 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 565 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 565 aa  100  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  30.55 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  30.64 
 
 		 563 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  29.23 
 
 		 575 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  26.98 
 
 		 566 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 559 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  29.33 
 
 		 588 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  29.72 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  29.11 
 
 		 421 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  28.16 
 
 		 734 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  26.7 
 
 		 420 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  29.06 
 
 		 557 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  27.32 
 
 		 732 aa  91.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  26.33 
 
 		 630 aa  91.3  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 		 299 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  30.7 
 
 		 397 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  30.7 
 
 		 397 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  28.03 
 
 		 559 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  30.7 
 
 		 397 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  30.7 
 
 		 397 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.36 
 
 		 299 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  28.16 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 		 299 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  28.82 
 
 		 442 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  28.74 
 
 		 428 aa  87.8  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  27.62 
 
 		 324 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  28.37 
 
 		 398 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  28.37 
 
 		 398 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 398 aa  87  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.96 
 
 		 304 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.63 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  28.81 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  29.82 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  27.7 
 
 		 624 aa  84.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  29.03 
 
 		 770 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  27.05 
 
 		 299 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.36 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.09 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.27 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  25.29 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  28.08 
 
 		 577 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  28.08 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.48 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  26.98 
 
 		 733 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.31 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  25.78 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 299 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.53 
 
 		 294 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 618 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  25.61 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.71 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.38 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.7 
 
 		 616 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 618 aa  74.3  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  24.48 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  25.72 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  27.32 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 559 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 311 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.51 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>