More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4967 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  100 
 
 		 495 aa  986    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  49.09 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  46.4 
 
 		 495 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  44.85 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  44.31 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  38.63 
 
 		 527 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  28 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  28.49 
 
 		 394 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  29.41 
 
 		 704 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  29.41 
 
 		 704 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  31.67 
 
 		 428 aa  95.1  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  29.8 
 
 		 417 aa  91.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.44 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  28.13 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  30.5 
 
 		 398 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  30.5 
 
 		 398 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  30.5 
 
 		 398 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  30.77 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  28.57 
 
 		 421 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  30.49 
 
 		 630 aa  87.8  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 618 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1772  phage integrase-like protein SAM-like protein  54.95 
 
 		 93 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62021  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  28.25 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  28.24 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  28.24 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  28.24 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  28.24 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  28.72 
 
 		 732 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  29.79 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  26.92 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  27.89 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  29.75 
 
 		 770 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 624 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  25.14 
 
 		 716 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  28.82 
 
 		 618 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.89 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  29.63 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  31.55 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  29.41 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  30.79 
 
 		 295 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  29.48 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  25 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  33.53 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  28.37 
 
 		 734 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  28.23 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  28.23 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  31.58 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  27.44 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  29.55 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  28.15 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  28.15 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  31.3 
 
 		 609 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  26.48 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  28.86 
 
 		 588 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  28.15 
 
 		 578 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.96 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  27.76 
 
 		 578 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  28.27 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  28.13 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.87 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  27.33 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  24.61 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 559 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  28.92 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.03 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  26.93 
 
 		 566 aa  67  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  28.92 
 
 		 294 aa  67  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  26.6 
 
 		 563 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.64 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  26.22 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  27.1 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.97 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  23.36 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.8 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.41 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.95 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.19 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  31.45 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  22.54 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  27.6 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.4 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  26.75 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  22.96 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.25 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  26.25 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  27.53 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  27.32 
 
 		 559 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  21.01 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  27.5 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  29.21 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>