More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_7054 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  66.25 
 
 		 565 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  64.18 
 
 		 563 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  63.69 
 
 		 559 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  68.64 
 
 		 566 aa  724    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  88.58 
 
 		 575 aa  989    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  63.86 
 
 		 566 aa  711    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  66.25 
 
 		 565 aa  698    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  63.94 
 
 		 563 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  66.43 
 
 		 559 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  98.79 
 
 		 578 aa  1117    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  93.25 
 
 		 578 aa  1039    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  100 
 
 		 578 aa  1130    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  66.25 
 
 		 565 aa  698    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  66.31 
 
 		 563 aa  705    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  64.96 
 
 		 559 aa  672    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  67.99 
 
 		 559 aa  716    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  98.96 
 
 		 578 aa  1118    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  64.76 
 
 		 565 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  62.98 
 
 		 565 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  64.94 
 
 		 565 aa  691    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  93.08 
 
 		 578 aa  1045    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  66.25 
 
 		 565 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  93.28 
 
 		 580 aa  1048    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  65.91 
 
 		 566 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  71.97 
 
 		 442 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  64.06 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  58.02 
 
 		 557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  54.42 
 
 		 580 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  54.25 
 
 		 588 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  67.1 
 
 		 248 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  33.46 
 
 		 704 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  33.46 
 
 		 704 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  38.61 
 
 		 770 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  33.16 
 
 		 716 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  57.77 
 
 		 222 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  40.65 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.51 
 
 		 733 aa  216  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  34.69 
 
 		 710 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  34.87 
 
 		 630 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  36.73 
 
 		 394 aa  203  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  35.29 
 
 		 422 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  35.63 
 
 		 417 aa  196  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  35.9 
 
 		 399 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  34.74 
 
 		 421 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  35.44 
 
 		 420 aa  184  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  36.36 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  57.74 
 
 		 185 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  31.53 
 
 		 577 aa  180  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  35.84 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  35.84 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  35.84 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  35.84 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  34.43 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  31.07 
 
 		 577 aa  179  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  34.43 
 
 		 398 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  34.43 
 
 		 398 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  32.42 
 
 		 609 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  34.32 
 
 		 420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  32.99 
 
 		 609 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 618 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  34.16 
 
 		 397 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  31.21 
 
 		 624 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  29.01 
 
 		 797 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  29.36 
 
 		 732 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  30.14 
 
 		 734 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 618 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  35.74 
 
 		 616 aa  124  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  28.85 
 
 		 376 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 436 aa  117  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  33.87 
 
 		 398 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  28.29 
 
 		 444 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  29.78 
 
 		 527 aa  110  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  32.83 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  33.33 
 
 		 527 aa  107  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  31.03 
 
 		 490 aa  100  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 415 aa  97.4  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  30.16 
 
 		 495 aa  94.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 417 aa  93.6  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  25.26 
 
 		 406 aa  93.2  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  26.53 
 
 		 408 aa  91.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 415 aa  90.5  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  26.53 
 
 		 408 aa  90.5  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 		 296 aa  90.5  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  27.4 
 
 		 430 aa  90.1  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  31.51 
 
 		 508 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  23.45 
 
 		 418 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  30.08 
 
 		 306 aa  89.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  29.15 
 
 		 495 aa  87  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  29.55 
 
 		 317 aa  87  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  31.19 
 
 		 295 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  35.88 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  33.52 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  29.56 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  37.13 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  29.77 
 
 		 303 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  36.53 
 
 		 293 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  28.85 
 
 		 300 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.16 
 
 		 298 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  27.84 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>