More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4473 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  100 
 
 		 609 aa  1224    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  78.3 
 
 		 609 aa  932    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  48.24 
 
 		 624 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.23 
 
 		 733 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  31.92 
 
 		 704 aa  220  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  31.92 
 
 		 704 aa  220  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  32.18 
 
 		 630 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  30.4 
 
 		 710 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  31.12 
 
 		 770 aa  187  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  29.29 
 
 		 716 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  33.07 
 
 		 578 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  33.07 
 
 		 578 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  32.88 
 
 		 578 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  33.2 
 
 		 566 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  30.52 
 
 		 618 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  32.61 
 
 		 575 aa  164  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  32.03 
 
 		 578 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  32.52 
 
 		 580 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  31.56 
 
 		 578 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  31.04 
 
 		 563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  31.21 
 
 		 580 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 565 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 565 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 565 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 565 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  31.1 
 
 		 565 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  31.19 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  30.89 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  30.53 
 
 		 588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  30.81 
 
 		 566 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  31.34 
 
 		 566 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  32.09 
 
 		 559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  32.09 
 
 		 507 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  31.15 
 
 		 563 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  28.85 
 
 		 559 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  29.96 
 
 		 557 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  29.88 
 
 		 559 aa  142  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  34.37 
 
 		 442 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 565 aa  137  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.96 
 
 		 616 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  35.44 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  30.59 
 
 		 577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  34.8 
 
 		 411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  30.98 
 
 		 577 aa  127  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  30.03 
 
 		 422 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  31.16 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  29.39 
 
 		 618 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  31.44 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  31 
 
 		 397 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  31 
 
 		 397 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  31 
 
 		 397 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  31 
 
 		 397 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  24.16 
 
 		 732 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  28.69 
 
 		 417 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  29.43 
 
 		 420 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  25.71 
 
 		 734 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  29.12 
 
 		 399 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  30.15 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  29.33 
 
 		 398 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 398 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  29.33 
 
 		 398 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  26.8 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 436 aa  97.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  27.47 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  25.7 
 
 		 408 aa  90.5  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  25.7 
 
 		 408 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  29.59 
 
 		 398 aa  87.4  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  30.35 
 
 		 495 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  29.09 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  28.06 
 
 		 508 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  24.47 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  28.45 
 
 		 490 aa  77  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.39 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  24.06 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  25.83 
 
 		 797 aa  71.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  24.79 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  23.18 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  32.18 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  27.97 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  28.17 
 
 		 302 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  27.6 
 
 		 413 aa  66.6  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  24.65 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  22.49 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  25.41 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_003296  RS02236  putative prolin-rich protein  32.85 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  22.46 
 
 		 282 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  25.05 
 
 		 527 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25.48 
 
 		 295 aa  63.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  26.63 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  26.75 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  34.88 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.38 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.43 
 
 		 302 aa  62  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>