291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4614 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  100 
 
 		 185 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  80 
 
 		 588 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  77.14 
 
 		 580 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  57.14 
 
 		 578 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  56.55 
 
 		 559 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  57.74 
 
 		 578 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  57.74 
 
 		 563 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  57.74 
 
 		 565 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  57.74 
 
 		 565 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  57.74 
 
 		 565 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  57.74 
 
 		 578 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  57.74 
 
 		 565 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  57.74 
 
 		 578 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  57.74 
 
 		 580 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  57.74 
 
 		 578 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  58.33 
 
 		 575 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  56.55 
 
 		 442 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  54.76 
 
 		 566 aa  174  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  53.57 
 
 		 566 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  55.42 
 
 		 563 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  54.65 
 
 		 559 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  54.44 
 
 		 559 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  54.17 
 
 		 565 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  54.17 
 
 		 565 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  54.65 
 
 		 507 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  54.65 
 
 		 559 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  53.53 
 
 		 566 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  52.98 
 
 		 563 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  52.33 
 
 		 565 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  53.61 
 
 		 557 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  35.8 
 
 		 704 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  35.8 
 
 		 704 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  39.07 
 
 		 716 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  36.42 
 
 		 770 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  36.14 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5732  integrase family protein  35.61 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  41.4 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  34.36 
 
 		 420 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  33.53 
 
 		 422 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  34.15 
 
 		 733 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  33.14 
 
 		 421 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  36.14 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  33.92 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  34.15 
 
 		 397 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  34.15 
 
 		 397 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  34.15 
 
 		 397 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  34.15 
 
 		 397 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  30.43 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  33.77 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  32.93 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  33.97 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  33.97 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  33.97 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1679  phage integrase  60 
 
 		 54 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.493771  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 417 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  31.25 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  34.64 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  36.67 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  31.33 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  34.13 
 
 		 495 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  33.33 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  42.68 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  32.37 
 
 		 624 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  28.26 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  26.62 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  32.9 
 
 		 508 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 297 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  35.95 
 
 		 630 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  32.3 
 
 		 415 aa  52.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  29.05 
 
 		 376 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  33.33 
 
 		 490 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  28.26 
 
 		 336 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  34.91 
 
 		 618 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  34.81 
 
 		 293 aa  51.6  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  26.92 
 
 		 305 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  40.43 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  57.14 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 609 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  24.67 
 
 		 307 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  28.05 
 
 		 336 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  28.05 
 
 		 336 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.25 
 
 		 412 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  28.05 
 
 		 336 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  28.05 
 
 		 336 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  33.33 
 
 		 294 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 305 aa  49.3  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  33.9 
 
 		 300 aa  49.7  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  44.26 
 
 		 302 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  34.81 
 
 		 294 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  60 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  33.61 
 
 		 797 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  31.29 
 
 		 527 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0849  integrase family protein  30.38 
 
 		 380 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.607856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  38.46 
 
 		 307 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  26.09 
 
 		 330 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  45.28 
 
 		 307 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  45.24 
 
 		 294 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  45.28 
 
 		 307 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0057  integrase-recombinase  26.04 
 
 		 381 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0945594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  34.01 
 
 		 320 aa  47.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>