More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5732 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5732  integrase family protein  100 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  82.1 
 
 		 770 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  34.43 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  34.43 
 
 		 559 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  35.61 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  33.61 
 
 		 557 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  35.21 
 
 		 559 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  36.36 
 
 		 578 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  35.2 
 
 		 578 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  35.2 
 
 		 578 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  35.2 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  33.08 
 
 		 580 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 563 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  34.92 
 
 		 442 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  31.21 
 
 		 733 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  34.92 
 
 		 575 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  30.41 
 
 		 563 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  34.92 
 
 		 580 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  35.11 
 
 		 566 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  34.46 
 
 		 565 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  36.67 
 
 		 704 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  36.67 
 
 		 704 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  34.13 
 
 		 578 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  38.55 
 
 		 559 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  31.29 
 
 		 559 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  40.8 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  31.54 
 
 		 588 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  38.61 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  40.82 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  31.75 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  33.09 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.24 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  33.09 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  36.36 
 
 		 616 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  40 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0259  phage integrase  45.05 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  62.22 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  36 
 
 		 422 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  46.38 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  44.93 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.33 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  62.22 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  37.61 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  41.27 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  39.25 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.19 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  31.5 
 
 		 566 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  52.46 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  48 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.84 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  41.76 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.45 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  36.11 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  37.5 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  56.6 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.29 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.05 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  42.53 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  29.75 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  48.39 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  43.75 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  55.32 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  38.82 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  56.52 
 
 		 326 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  40.66 
 
 		 365 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.52 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0222  phage integrase family protein  60 
 
 		 308 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  40.66 
 
 		 365 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.58 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.52 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  55.77 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  44.71 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  44.23 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.86 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.23 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  36.36 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  44.23 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  44.23 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  38.1 
 
 		 495 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  47.95 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  44.05 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  44.83 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  42 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  58.7 
 
 		 443 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  57.45 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  46.38 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  36.63 
 
 		 490 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>