More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1227 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  100 
 
 		 559 aa  1006    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  64.23 
 
 		 566 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  100 
 
 		 507 aa  1005    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  64.3 
 
 		 563 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  63.14 
 
 		 565 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  63.14 
 
 		 565 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  63.14 
 
 		 565 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  63.14 
 
 		 565 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  63.71 
 
 		 559 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  62.38 
 
 		 565 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  65.67 
 
 		 566 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  62.18 
 
 		 565 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  62.23 
 
 		 565 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  64.06 
 
 		 578 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  63.87 
 
 		 578 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  64.12 
 
 		 575 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  63.87 
 
 		 578 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  61.95 
 
 		 563 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  64.29 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  62.57 
 
 		 578 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  62.38 
 
 		 580 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  65.02 
 
 		 566 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  62.96 
 
 		 578 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  60.71 
 
 		 559 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  62.25 
 
 		 563 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  61.63 
 
 		 559 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  69.02 
 
 		 442 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  54 
 
 		 580 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  53.41 
 
 		 588 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  34.42 
 
 		 704 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  34.42 
 
 		 704 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  32.78 
 
 		 716 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  35.5 
 
 		 630 aa  228  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  36.68 
 
 		 770 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  54.37 
 
 		 222 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  38.71 
 
 		 411 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.89 
 
 		 733 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  35.88 
 
 		 422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  33.15 
 
 		 710 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  55.03 
 
 		 248 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  36.06 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  36.2 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  34.3 
 
 		 420 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  35.77 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  34.46 
 
 		 397 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  34.46 
 
 		 397 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  33.77 
 
 		 398 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  34.46 
 
 		 397 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  34.46 
 
 		 397 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  33.77 
 
 		 398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  33.77 
 
 		 398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  31.6 
 
 		 577 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  34.04 
 
 		 417 aa  173  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  31.41 
 
 		 577 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  54.65 
 
 		 185 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  32.5 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  31.76 
 
 		 618 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.42 
 
 		 616 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  31.82 
 
 		 609 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  32.02 
 
 		 624 aa  160  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  33.84 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  34.77 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 618 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  31.95 
 
 		 609 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  27.6 
 
 		 732 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  28.57 
 
 		 734 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  28.02 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  25.95 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  27.91 
 
 		 444 aa  113  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  32.73 
 
 		 526 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  32.77 
 
 		 490 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  29.11 
 
 		 797 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  26.47 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  26.47 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  28.77 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  32.78 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 417 aa  97.8  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  26.02 
 
 		 406 aa  97.4  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  29.94 
 
 		 508 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  26.27 
 
 		 430 aa  93.2  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  23.94 
 
 		 415 aa  93.2  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  27.32 
 
 		 527 aa  88.6  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  28.69 
 
 		 495 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  25.48 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.98 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  22.57 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  27.6 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  25.12 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.34 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.34 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.1 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.34 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.34 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.93 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.34 
 
 		 299 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.34 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>