More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4251 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  100 
 
 		 624 aa  1290    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  48.89 
 
 		 609 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  48.09 
 
 		 609 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  31.28 
 
 		 733 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  26.9 
 
 		 704 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  26.9 
 
 		 704 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  29.69 
 
 		 630 aa  193  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  28.61 
 
 		 710 aa  193  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  28.83 
 
 		 770 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  31.01 
 
 		 588 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  25.72 
 
 		 716 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  31.32 
 
 		 563 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  30.46 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  31.21 
 
 		 566 aa  156  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  31.26 
 
 		 578 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  30.21 
 
 		 559 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  29.48 
 
 		 580 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  31.11 
 
 		 575 aa  154  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  31.06 
 
 		 578 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  31.06 
 
 		 578 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  31.95 
 
 		 559 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  31.33 
 
 		 507 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  30.88 
 
 		 559 aa  153  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  31.96 
 
 		 578 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  31.55 
 
 		 580 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 618 aa  150  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  29.31 
 
 		 557 aa  150  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  30.04 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.39 
 
 		 616 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  30.9 
 
 		 578 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  28.16 
 
 		 565 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  28.22 
 
 		 565 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 563 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  28.34 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  29.88 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  29.49 
 
 		 422 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  29.11 
 
 		 421 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.59 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  28.78 
 
 		 559 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  29.39 
 
 		 566 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  27.66 
 
 		 577 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  27.66 
 
 		 577 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  29.36 
 
 		 394 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  29.36 
 
 		 417 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  29.7 
 
 		 397 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  29.7 
 
 		 397 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  28.77 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  29.7 
 
 		 397 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  29.7 
 
 		 397 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  28.48 
 
 		 399 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  27.1 
 
 		 397 aa  114  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  28.41 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  28.22 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  28.22 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  28.22 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  23.65 
 
 		 734 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  23.45 
 
 		 732 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  30.49 
 
 		 490 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 436 aa  95.1  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  27.83 
 
 		 495 aa  87.4  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  23.81 
 
 		 376 aa  87  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  25.65 
 
 		 420 aa  87  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  28.57 
 
 		 495 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  24.32 
 
 		 797 aa  84.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  27.7 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  26.18 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  24.72 
 
 		 408 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  24.72 
 
 		 408 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  24.25 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  23.92 
 
 		 417 aa  80.1  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  26.88 
 
 		 508 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  24.04 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  29.58 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  27.48 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  24.59 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 278 aa  70.1  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  26.01 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  29.47 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02236  putative prolin-rich protein  25.86 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  29.1 
 
 		 317 aa  67  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  23.47 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.88 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  22.35 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.49 
 
 		 299 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 318 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  23.48 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3779  putative proline-rich protein  26.35 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0230018  normal  0.115334 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3891  putative prolin-rich protein  26.35 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  26.69 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 295 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  27.06 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>