More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0092 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  100 
 
 		 376 aa  783    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  31.2 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  31.77 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  30.92 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  30.92 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  30.92 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.04 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  29.51 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  28.65 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  28.45 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  27.58 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  28.93 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  28.93 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  28.93 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  28.93 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  29.32 
 
 		 578 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  29.84 
 
 		 575 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  29.32 
 
 		 580 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  29.02 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  29.12 
 
 		 578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  29.23 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  29.12 
 
 		 578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  28.45 
 
 		 563 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  27.96 
 
 		 565 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  28.85 
 
 		 578 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 565 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  26.93 
 
 		 716 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  28.69 
 
 		 563 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  27.79 
 
 		 557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  26.68 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 566 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  27.27 
 
 		 566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  27.99 
 
 		 559 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  28.19 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  27.85 
 
 		 565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  27.4 
 
 		 580 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  28.37 
 
 		 588 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  25.55 
 
 		 704 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  25.55 
 
 		 704 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  26.4 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  27.22 
 
 		 559 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  25.21 
 
 		 559 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  28.02 
 
 		 507 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 559 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  25.21 
 
 		 563 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 609 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 609 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  24.61 
 
 		 408 aa  99.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  24.61 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  24.86 
 
 		 630 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  24.04 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  26.02 
 
 		 577 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  27.79 
 
 		 770 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  26.02 
 
 		 577 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  26.63 
 
 		 733 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  27.27 
 
 		 411 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 436 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 624 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  23.85 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.53 
 
 		 308 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  25.06 
 
 		 710 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  25 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  25.29 
 
 		 527 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  23.91 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  22.14 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  22.14 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  23.64 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  24.86 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.97 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.29 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.29 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  24.46 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  24.05 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.93 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  25.13 
 
 		 734 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  30.36 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.09 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  23.92 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  25.9 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  24.52 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  24.54 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  25.07 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  22.22 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  27.24 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  30.34 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  25.34 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  25.07 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>