More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6456 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  62.57 
 
 		 565 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  67.38 
 
 		 566 aa  735    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  60.83 
 
 		 565 aa  669    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  65.5 
 
 		 575 aa  703    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  62.57 
 
 		 565 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  100 
 
 		 563 aa  1133    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  62.57 
 
 		 565 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  63.07 
 
 		 559 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  64.87 
 
 		 578 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  64.11 
 
 		 578 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  62.57 
 
 		 563 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  63.17 
 
 		 563 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  61.31 
 
 		 559 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  66.43 
 
 		 566 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  63.94 
 
 		 578 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  63.68 
 
 		 580 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  62.66 
 
 		 557 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  64.12 
 
 		 559 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  64.11 
 
 		 578 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  61.99 
 
 		 565 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  62.5 
 
 		 566 aa  698    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  62.17 
 
 		 565 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  62.57 
 
 		 565 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  64.59 
 
 		 559 aa  704    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  63.51 
 
 		 578 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  69.18 
 
 		 442 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  61.95 
 
 		 507 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  53.5 
 
 		 580 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  52.62 
 
 		 588 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  59.57 
 
 		 248 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  32.78 
 
 		 716 aa  231  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  55.5 
 
 		 222 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  32.7 
 
 		 704 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  32.7 
 
 		 704 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  36.71 
 
 		 770 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  38.32 
 
 		 411 aa  200  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  34.47 
 
 		 630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  37.43 
 
 		 399 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  31.53 
 
 		 733 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  32.23 
 
 		 710 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  35.01 
 
 		 420 aa  191  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  36.07 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  36.07 
 
 		 398 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  36.07 
 
 		 398 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  34.45 
 
 		 422 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  37.1 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  37.1 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  37.1 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  37.1 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  35.75 
 
 		 417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  35.92 
 
 		 428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  36.8 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  34.35 
 
 		 421 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  30.92 
 
 		 577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  30.8 
 
 		 577 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  33.67 
 
 		 618 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  55.42 
 
 		 185 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  34.52 
 
 		 397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  31.32 
 
 		 624 aa  160  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  33.79 
 
 		 420 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  31 
 
 		 609 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  30.65 
 
 		 609 aa  151  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  28.49 
 
 		 618 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  27.17 
 
 		 734 aa  135  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  36.67 
 
 		 616 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  26.64 
 
 		 732 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  34.09 
 
 		 490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  29.77 
 
 		 797 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  33.15 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  30.19 
 
 		 526 aa  114  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  28.16 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  25.21 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  30.64 
 
 		 527 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  26.46 
 
 		 444 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 417 aa  97.4  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  25.35 
 
 		 406 aa  97.4  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 436 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  26.68 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.34 
 
 		 415 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  29.72 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  25.53 
 
 		 408 aa  88.2  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  31.58 
 
 		 295 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  25.2 
 
 		 408 aa  87  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  32 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  29.74 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  29.47 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  27.98 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.52 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  26.33 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  28.33 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  30 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  28.92 
 
 		 398 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.62 
 
 		 308 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  26.02 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  26.44 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>