126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2857 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 444 aa  926    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  48.97 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  41.72 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  32.96 
 
 		 406 aa  249  7e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  32.73 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  36.1 
 
 		 408 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  35.03 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  36.92 
 
 		 415 aa  239  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  33.03 
 
 		 418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  34.78 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.96 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  29.96 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  29.34 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  29.53 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  29.43 
 
 		 440 aa  159  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  27.72 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 431 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  28.38 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  27.37 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  27.37 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.75 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  30.23 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  29.92 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  29.92 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  29.92 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  29.92 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  30.38 
 
 		 399 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  30.31 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  30.17 
 
 		 420 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  31.18 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  30.63 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  30.63 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  30.63 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  28.88 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  28.54 
 
 		 580 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  30.28 
 
 		 565 aa  118  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 566 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  28.75 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  28.29 
 
 		 578 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 578 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  27.14 
 
 		 557 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  28.21 
 
 		 588 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  28.5 
 
 		 563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  27.79 
 
 		 578 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  28.29 
 
 		 578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  26.8 
 
 		 578 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  27.42 
 
 		 559 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  27.99 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  28.25 
 
 		 575 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  27.79 
 
 		 580 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  28.32 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  30.02 
 
 		 559 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  27.34 
 
 		 566 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  26.99 
 
 		 559 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  27.39 
 
 		 507 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 559 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  27.48 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  27.41 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  28.61 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 565 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  25.12 
 
 		 704 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  25.12 
 
 		 704 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  26.46 
 
 		 563 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  23.95 
 
 		 716 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  24.24 
 
 		 630 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  22.22 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  24.03 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  26.7 
 
 		 770 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  25.96 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  31.49 
 
 		 191 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  25.06 
 
 		 733 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2384  integrase family protein  29.41 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  27.13 
 
 		 797 aa  60.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  31.14 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  28.52 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  25.88 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  27.51 
 
 		 508 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 609 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  22.13 
 
 		 609 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  39.05 
 
 		 190 aa  54.3  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 		 294 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  25.59 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  22.99 
 
 		 624 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  25.13 
 
 		 710 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  31.88 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 292 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  28.2 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>