More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4242 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  100 
 
 
418 aa  858    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.25 
 
 
412 aa  213  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  33.7 
 
 
415 aa  212  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  30.67 
 
 
417 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  30.67 
 
 
406 aa  196  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  31.96 
 
 
408 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  31.44 
 
 
408 aa  190  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  30.59 
 
 
415 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  31.52 
 
 
418 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  32.65 
 
 
430 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  30.89 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  26.59 
 
 
430 aa  153  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  26.74 
 
 
430 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  25.23 
 
 
430 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  26.34 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  26.79 
 
 
435 aa  139  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  24.6 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  27.2 
 
 
423 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  24.6 
 
 
431 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  25.46 
 
 
431 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  24.26 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  25.46 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  24.04 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  24.04 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  24.24 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  24.77 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  25.46 
 
 
440 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  27.88 
 
 
397 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  27.88 
 
 
397 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  27.88 
 
 
397 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  27.88 
 
 
397 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.69 
 
 
411 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  25.57 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  27.61 
 
 
421 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  26.95 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  25.86 
 
 
399 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  25.43 
 
 
288 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  26.3 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  26.63 
 
 
716 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  26.05 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  25.66 
 
 
398 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  25.66 
 
 
398 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  25.44 
 
 
376 aa  86.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  25.66 
 
 
398 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  25.26 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  25.19 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  23.9 
 
 
566 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  26.44 
 
 
563 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.61 
 
 
324 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  26.5 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  22.78 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  25.54 
 
 
559 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  31 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  24.57 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  24.57 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  25.95 
 
 
575 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  24.57 
 
 
578 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  25.17 
 
 
733 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  26.87 
 
 
770 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  26.1 
 
 
566 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  23.82 
 
 
578 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  24.81 
 
 
578 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  24.81 
 
 
580 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  24.61 
 
 
704 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  24.61 
 
 
704 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  23.97 
 
 
557 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.01 
 
 
300 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.01 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.01 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  23.44 
 
 
563 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  23.88 
 
 
565 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  24.4 
 
 
563 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  24.14 
 
 
609 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  23.88 
 
 
565 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  23.88 
 
 
565 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  28.63 
 
 
346 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  23.16 
 
 
565 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  23.88 
 
 
565 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  23.16 
 
 
565 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  24.74 
 
 
559 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  24.86 
 
 
588 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  30.14 
 
 
295 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.77 
 
 
319 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  27.94 
 
 
312 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  24.21 
 
 
624 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  34 
 
 
351 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  24.5 
 
 
507 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.14 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  24.5 
 
 
559 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  24.38 
 
 
609 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  32.22 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.88 
 
 
300 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  29.41 
 
 
308 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  24.52 
 
 
559 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.62 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  24.66 
 
 
580 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  26.18 
 
 
324 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  28.49 
 
 
273 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  26.09 
 
 
294 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  24.66 
 
 
566 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0271537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>