105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2370 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 288 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  90.94 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  90.59 
 
 		 431 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  90.62 
 
 		 431 aa  544  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  83.68 
 
 		 431 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  83.68 
 
 		 431 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  82.64 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  81.94 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  81.94 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  76.04 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  75.69 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  71.53 
 
 		 430 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  70.03 
 
 		 435 aa  431  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  67.01 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  70.49 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  37.05 
 
 		 411 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  37.28 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  36.65 
 
 		 406 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  37.37 
 
 		 415 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  30.53 
 
 		 430 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  30.85 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  31.29 
 
 		 444 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.5 
 
 		 412 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  29.55 
 
 		 434 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  29.33 
 
 		 418 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 418 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  27.49 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  26.74 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  26.74 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  26.74 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  26.74 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.65 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  29.56 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  28.37 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  27.17 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  26.78 
 
 		 399 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  26.52 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  28.36 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  28.36 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  28.36 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  25.44 
 
 		 716 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  23.76 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  25.68 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  24.08 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  26.16 
 
 		 563 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  26.87 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  24.82 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  32.88 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  32.43 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 559 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  25.81 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 565 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  24.64 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  25.27 
 
 		 566 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  26.67 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  25 
 
 		 557 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  25.19 
 
 		 563 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.01 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 559 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  25.36 
 
 		 398 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 563 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  24.65 
 
 		 565 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 566 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  25.09 
 
 		 578 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  25.26 
 
 		 413 aa  52.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  23.47 
 
 		 704 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  23.63 
 
 		 630 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  23.47 
 
 		 704 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  29.71 
 
 		 527 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.35 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25.53 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  24.16 
 
 		 495 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  29.53 
 
 		 495 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  22.85 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  33.93 
 
 		 190 aa  48.9  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  24.13 
 
 		 578 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  23.38 
 
 		 442 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  24.91 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  24.13 
 
 		 578 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  24.64 
 
 		 565 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  24.82 
 
 		 565 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  24.66 
 
 		 578 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  25 
 
 		 578 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  25 
 
 		 580 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  25.09 
 
 		 575 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.91 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  23.36 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  23.08 
 
 		 559 aa  45.8  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  25.28 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  24.6 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  23.02 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  21.79 
 
 		 580 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  23.62 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>