183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2207 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  83.72 
 
 		 430 aa  763    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  100 
 
 		 430 aa  901    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  72.16 
 
 		 431 aa  666    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  72.56 
 
 		 431 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  72.33 
 
 		 431 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  72.85 
 
 		 431 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  71.46 
 
 		 431 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  71.46 
 
 		 431 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  71.93 
 
 		 431 aa  663    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  70 
 
 		 430 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  72.16 
 
 		 431 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  67.13 
 
 		 435 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  66.82 
 
 		 423 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  65.67 
 
 		 440 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  75.69 
 
 		 288 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  34.49 
 
 		 411 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  33.56 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  33.56 
 
 		 417 aa  240  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  36.18 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  30.37 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  30.52 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2367  hypothetical protein  63.89 
 
 		 146 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  30.53 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  28.61 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  29.1 
 
 		 415 aa  155  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  26.13 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.01 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  24.14 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  28.53 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  26.08 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  26.08 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  26.08 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  26.08 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  25.86 
 
 		 716 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.18 
 
 		 411 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  25.53 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  24.93 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  23.94 
 
 		 428 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  24.47 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  24.47 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  23.4 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  25.74 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  24.52 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  24.16 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  24.93 
 
 		 630 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  23.18 
 
 		 704 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  23.18 
 
 		 704 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 565 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 565 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 565 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 565 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  24.73 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  21.89 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  25.17 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  25.75 
 
 		 563 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  25.14 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  24.74 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  24.74 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  23.97 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  23.45 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  24.24 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  23.48 
 
 		 770 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  22.56 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  23.45 
 
 		 578 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  23.91 
 
 		 575 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 559 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  21.6 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  23.45 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  23.62 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  22.8 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  22.93 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  21.92 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  23.93 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  27.03 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  23.93 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  23.62 
 
 		 588 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  22.63 
 
 		 317 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  25.37 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  23.48 
 
 		 559 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  23.91 
 
 		 557 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  21.66 
 
 		 290 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  22.59 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  23.98 
 
 		 733 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  22.18 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.1 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  24.91 
 
 		 294 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4624  integrase family protein  22.79 
 
 		 353 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.00236939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  29.02 
 
 		 326 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  22.7 
 
 		 295 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  26.26 
 
 		 294 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  20.51 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  23.27 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>