183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2111 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  100 
 
 		 411 aa  858    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  38.12 
 
 		 431 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  38.12 
 
 		 431 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  38.85 
 
 		 423 aa  288  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  38.22 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  37.22 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  37.62 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  37.62 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  37.38 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  38.21 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  35.41 
 
 		 431 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  35.41 
 
 		 431 aa  269  7e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  35.41 
 
 		 431 aa  266  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  36.82 
 
 		 440 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  34.49 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  29.08 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  37.05 
 
 		 288 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  28.84 
 
 		 417 aa  192  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  31.06 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  31.06 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  28.53 
 
 		 415 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  29.18 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  28.38 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  29.44 
 
 		 430 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.02 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  26.61 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  25.75 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  24.94 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  27.76 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.54 
 
 		 411 aa  99.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  28.53 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  29.53 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  28.81 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  29.53 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  29.53 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  28.81 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  29.53 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  25 
 
 		 716 aa  93.2  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  29.62 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  24.59 
 
 		 704 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  24.59 
 
 		 704 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  28.13 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  27.76 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  26.26 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  27.27 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  23.18 
 
 		 420 aa  86.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2367  hypothetical protein  30.94 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  26 
 
 		 733 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  25.65 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  26.9 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  27.63 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  25.53 
 
 		 563 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  31.69 
 
 		 191 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  27.18 
 
 		 559 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  26.53 
 
 		 770 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  24.8 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  29.01 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  24.19 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  27.92 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  27.92 
 
 		 578 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  24.93 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 578 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  26.78 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  24.92 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 565 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 565 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 565 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 565 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  25.94 
 
 		 563 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  27.27 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  25.61 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  29.43 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 563 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  33.33 
 
 		 527 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  26.45 
 
 		 578 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  26.42 
 
 		 575 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  25.95 
 
 		 580 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  26.21 
 
 		 588 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  27.08 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 624 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  26.32 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 618 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  25.61 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  32.2 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  28.74 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  24.23 
 
 		 630 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2384  integrase family protein  25.48 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1780  integrase family protein  30.11 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  23.08 
 
 		 710 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  21.43 
 
 		 282 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  26.04 
 
 		 323 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>