More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4706 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  64.18 
 
 		 578 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  66.78 
 
 		 566 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  80.78 
 
 		 565 aa  918    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  62.57 
 
 		 563 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  63.93 
 
 		 580 aa  685    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  82.61 
 
 		 559 aa  911    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  63.79 
 
 		 575 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  62.48 
 
 		 578 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  63.92 
 
 		 566 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  62.98 
 
 		 565 aa  686    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  62.7 
 
 		 566 aa  704    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  63.43 
 
 		 557 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  80.78 
 
 		 565 aa  918    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  65.7 
 
 		 559 aa  692    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  64.52 
 
 		 559 aa  676    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  64.01 
 
 		 578 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  74.91 
 
 		 565 aa  837    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  80.78 
 
 		 565 aa  918    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  80.78 
 
 		 565 aa  918    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  62.8 
 
 		 578 aa  688    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  75.09 
 
 		 565 aa  838    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  64.01 
 
 		 578 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  60.22 
 
 		 559 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  80.78 
 
 		 563 aa  910    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  100 
 
 		 563 aa  1118    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  72.4 
 
 		 442 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  62.25 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  54.72 
 
 		 580 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  54.55 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  34.63 
 
 		 716 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  33.39 
 
 		 704 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  33.39 
 
 		 704 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  56.6 
 
 		 222 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  36.54 
 
 		 630 aa  231  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  37.55 
 
 		 770 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  53.91 
 
 		 248 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  34.95 
 
 		 710 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  35.32 
 
 		 422 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  34.05 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  36.58 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  34.56 
 
 		 394 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  33.86 
 
 		 420 aa  191  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.06 
 
 		 733 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  33.86 
 
 		 398 aa  187  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  34.12 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  34.12 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  35.22 
 
 		 397 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  35.22 
 
 		 397 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  35.22 
 
 		 397 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  35.22 
 
 		 397 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  30.8 
 
 		 577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  30.8 
 
 		 577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  34.79 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  33.98 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  33.33 
 
 		 428 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  33.85 
 
 		 399 aa  181  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  36.59 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  33.27 
 
 		 618 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  52.98 
 
 		 185 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 609 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  30.75 
 
 		 618 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  29.17 
 
 		 734 aa  161  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  30.04 
 
 		 624 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  30.98 
 
 		 609 aa  156  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  41 
 
 		 616 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  27.09 
 
 		 732 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  25.89 
 
 		 797 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  28.45 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  28.21 
 
 		 434 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  31.78 
 
 		 526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  27.98 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  30.22 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  31.13 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  31.54 
 
 		 508 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.76 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  26.78 
 
 		 408 aa  98.6  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  26.78 
 
 		 408 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  30.81 
 
 		 495 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  30 
 
 		 527 aa  97.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  30.52 
 
 		 398 aa  97.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  29.89 
 
 		 495 aa  94.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  25.65 
 
 		 406 aa  94  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 417 aa  93.6  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  30.83 
 
 		 293 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  24.65 
 
 		 418 aa  87.8  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  26.4 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  33.87 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  30.19 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  30.49 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.84 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  33.52 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.33 
 
 		 299 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.33 
 
 		 299 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  30.7 
 
 		 295 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.33 
 
 		 299 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.33 
 
 		 299 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.33 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.33 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  35.36 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>