More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4983 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  100 
 
 		 588 aa  1151    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  90.17 
 
 		 580 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  57.37 
 
 		 563 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  57.3 
 
 		 559 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  56.06 
 
 		 565 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  56.06 
 
 		 565 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  56.06 
 
 		 565 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  54.95 
 
 		 565 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  56.06 
 
 		 565 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  56.35 
 
 		 566 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  56.53 
 
 		 559 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  54.77 
 
 		 565 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  55.07 
 
 		 566 aa  561  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  55.5 
 
 		 566 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  54.78 
 
 		 580 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  54.36 
 
 		 578 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  54.04 
 
 		 565 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  54.25 
 
 		 578 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  55.34 
 
 		 575 aa  548  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  54.59 
 
 		 578 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  54.59 
 
 		 578 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  53.74 
 
 		 578 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  54.79 
 
 		 559 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  54.55 
 
 		 563 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  53.11 
 
 		 559 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  52.62 
 
 		 563 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  53.15 
 
 		 557 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  53.41 
 
 		 507 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  56.85 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  84.21 
 
 		 222 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  80 
 
 		 185 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  38.73 
 
 		 770 aa  239  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  34.95 
 
 		 704 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  34.95 
 
 		 704 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  33.21 
 
 		 716 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  39.68 
 
 		 411 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  33.33 
 
 		 710 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  37.3 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.4 
 
 		 733 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  36.1 
 
 		 630 aa  200  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  36.6 
 
 		 394 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  37.96 
 
 		 420 aa  194  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  33.5 
 
 		 577 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  38.46 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  33.45 
 
 		 577 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  38.1 
 
 		 398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  37.93 
 
 		 398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  37.93 
 
 		 398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  36.65 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  38.85 
 
 		 399 aa  183  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  45.37 
 
 		 248 aa  180  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  37.8 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  37.8 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  37.8 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  37.8 
 
 		 397 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  36.55 
 
 		 421 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  35.77 
 
 		 397 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  33.55 
 
 		 618 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  34.41 
 
 		 420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  31.3 
 
 		 624 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  30 
 
 		 732 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  32.29 
 
 		 616 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  31.07 
 
 		 734 aa  154  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  30.53 
 
 		 609 aa  150  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  31.5 
 
 		 609 aa  146  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 618 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  27.96 
 
 		 434 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  28.37 
 
 		 376 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  28.2 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  30.33 
 
 		 526 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  28.21 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  31 
 
 		 527 aa  107  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  29.32 
 
 		 408 aa  106  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  33.62 
 
 		 495 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  29.17 
 
 		 408 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  31.92 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  29.33 
 
 		 527 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  31.47 
 
 		 508 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 417 aa  98.6  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  25.66 
 
 		 406 aa  98.6  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  32.8 
 
 		 398 aa  97.8  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.34 
 
 		 415 aa  96.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  30.03 
 
 		 495 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  24.46 
 
 		 418 aa  94  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  27.84 
 
 		 430 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  26.71 
 
 		 797 aa  84.7  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  31.76 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.19 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  35.16 
 
 		 191 aa  80.1  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  30.12 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.84 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  25.94 
 
 		 336 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  29.96 
 
 		 290 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  27.83 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.35 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  31.82 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.23 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.51 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>