More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3359 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  84.92 
 
 		 417 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  54.1 
 
 		 411 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  50 
 
 		 397 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  50 
 
 		 397 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  50 
 
 		 397 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  50 
 
 		 397 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  53.33 
 
 		 399 aa  195  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  50 
 
 		 398 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  49.44 
 
 		 420 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  50 
 
 		 398 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  50 
 
 		 398 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  50 
 
 		 428 aa  188  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  45 
 
 		 421 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  46.63 
 
 		 422 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  47.19 
 
 		 394 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  52.27 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  32.8 
 
 		 397 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  36.07 
 
 		 580 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  35.96 
 
 		 575 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  28.65 
 
 		 704 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  34.09 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  28.65 
 
 		 704 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  34.09 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  34.83 
 
 		 580 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  34.83 
 
 		 578 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  34.83 
 
 		 578 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  34.83 
 
 		 578 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  34.27 
 
 		 578 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  34.83 
 
 		 578 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  35.63 
 
 		 559 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  35.16 
 
 		 588 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  33.92 
 
 		 415 aa  79  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  32.75 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  33.92 
 
 		 566 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  32.28 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  34.91 
 
 		 557 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  34.46 
 
 		 566 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  28.57 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  33.15 
 
 		 563 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  37.68 
 
 		 490 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  32.4 
 
 		 398 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  31.69 
 
 		 411 aa  71.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  30.21 
 
 		 716 aa  70.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  30 
 
 		 770 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  32.73 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  32.75 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  34.46 
 
 		 566 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 406 aa  68.6  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  29.59 
 
 		 413 aa  68.2  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.24 
 
 		 412 aa  68.6  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  28.98 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  36.88 
 
 		 508 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  33.33 
 
 		 495 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  33.92 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  32.94 
 
 		 495 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 565 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 565 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 565 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  32.76 
 
 		 565 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.12 
 
 		 290 aa  64.7  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  28.74 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  28.74 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  30.51 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.83 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  32.2 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  31.18 
 
 		 507 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  31.18 
 
 		 559 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  27.32 
 
 		 630 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  28.14 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  31.43 
 
 		 563 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  30.46 
 
 		 563 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  31.61 
 
 		 559 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  30.29 
 
 		 565 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 565 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  30.99 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  30.12 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.59 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 565 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0136  site-specific tyrosine recombinase XerS  26.14 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.293476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.63 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.73 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  27.54 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.22 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.63 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.63 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.89 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2052  integrase family protein  32.75 
 
 		 353 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00829339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.22 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.63 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  26.11 
 
 		 338 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 618 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  31.25 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>