More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2135 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  100 
 
 
394 aa  805    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  58.31 
 
 
421 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  62.14 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  60.84 
 
 
420 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  60.84 
 
 
398 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  60.84 
 
 
398 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  60.84 
 
 
398 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  56.85 
 
 
411 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  56.92 
 
 
397 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  56.92 
 
 
397 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  56.92 
 
 
397 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  55.87 
 
 
422 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  56.92 
 
 
397 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  55.73 
 
 
399 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  50.78 
 
 
417 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  40.93 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  36.27 
 
 
565 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  36.27 
 
 
565 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  36.27 
 
 
565 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  36.27 
 
 
565 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  36.32 
 
 
566 aa  207  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  36.18 
 
 
563 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  36.73 
 
 
578 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  36.39 
 
 
559 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  36.53 
 
 
565 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  37.28 
 
 
575 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  36.2 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  35.97 
 
 
580 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  36.2 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  35.97 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  35.14 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  36.62 
 
 
566 aa  199  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  35.46 
 
 
578 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  36.51 
 
 
580 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  36.6 
 
 
588 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  58.86 
 
 
190 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  35.68 
 
 
559 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  34.56 
 
 
563 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  35.6 
 
 
566 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  35.29 
 
 
559 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  34.35 
 
 
565 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  34.12 
 
 
557 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  34.35 
 
 
565 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  35.73 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  36.8 
 
 
563 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  36.52 
 
 
630 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  47.19 
 
 
191 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  35.82 
 
 
559 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  35.82 
 
 
507 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  36.36 
 
 
770 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  31.74 
 
 
716 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  31.91 
 
 
704 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  31.91 
 
 
704 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.21 
 
 
733 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  28.19 
 
 
406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  28.19 
 
 
417 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  28.46 
 
 
408 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  34.71 
 
 
398 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  28.21 
 
 
408 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  31.93 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  28.45 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  32.36 
 
 
577 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  32.36 
 
 
577 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  31.69 
 
 
618 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  31.88 
 
 
710 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  28.79 
 
 
415 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  27.7 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  27.96 
 
 
732 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  26.84 
 
 
734 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  29.36 
 
 
624 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  31.17 
 
 
430 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  28.17 
 
 
618 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  29.97 
 
 
415 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  29.98 
 
 
444 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  31.16 
 
 
609 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  25.65 
 
 
797 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  44.22 
 
 
222 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.12 
 
 
616 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  30.87 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  28.8 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  26.89 
 
 
431 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  26.89 
 
 
431 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  29.01 
 
 
609 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  27.18 
 
 
430 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  26.41 
 
 
431 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  25.67 
 
 
431 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  25.67 
 
 
431 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  26.72 
 
 
418 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  25.92 
 
 
430 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  25.2 
 
 
423 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  27.76 
 
 
411 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  27.22 
 
 
495 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  28.13 
 
 
490 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3779  putative proline-rich protein  30.63 
 
 
427 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0230018  normal  0.115334 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3891  putative prolin-rich protein  30.63 
 
 
427 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  24.34 
 
 
435 aa  96.7  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  25.65 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  25.2 
 
 
431 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  25.73 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.59 
 
 
412 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>