More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1337 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  66.12 
 
 		 565 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  100 
 
 		 565 aa  1118    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  63.51 
 
 		 566 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  62.98 
 
 		 563 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  66.12 
 
 		 565 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  63.08 
 
 		 580 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  60.83 
 
 		 563 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  64.77 
 
 		 563 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  63.78 
 
 		 559 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  64.55 
 
 		 565 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  61.19 
 
 		 559 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  63.3 
 
 		 578 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  61.76 
 
 		 559 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  66.12 
 
 		 565 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  66.55 
 
 		 575 aa  693    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  62.8 
 
 		 578 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  65.54 
 
 		 557 aa  673    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  62.98 
 
 		 566 aa  694    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  62.98 
 
 		 578 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  61.43 
 
 		 559 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  62.8 
 
 		 578 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  64.55 
 
 		 565 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  66.12 
 
 		 565 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  63.83 
 
 		 578 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  61.59 
 
 		 566 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  62.23 
 
 		 507 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  69.57 
 
 		 442 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  54.22 
 
 		 580 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  54.04 
 
 		 588 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  34.67 
 
 		 716 aa  256  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  34.17 
 
 		 704 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  34.17 
 
 		 704 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  61.73 
 
 		 222 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  36.94 
 
 		 770 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  37.08 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  39.02 
 
 		 411 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  34.55 
 
 		 630 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  36.7 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  32.82 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  49.57 
 
 		 248 aa  207  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  32.53 
 
 		 577 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  36.72 
 
 		 398 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  36.72 
 
 		 398 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  36.72 
 
 		 398 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  36.53 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  32.82 
 
 		 733 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  39.11 
 
 		 397 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  39.11 
 
 		 397 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  39.11 
 
 		 397 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  39.11 
 
 		 397 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  34.99 
 
 		 421 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  35.9 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  36.65 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  36.43 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  31.75 
 
 		 710 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  33.58 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 618 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  52.33 
 
 		 185 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  35.98 
 
 		 397 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  30.92 
 
 		 609 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  28.16 
 
 		 734 aa  150  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  28.57 
 
 		 732 aa  147  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 618 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  28.54 
 
 		 624 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.13 
 
 		 616 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 609 aa  133  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  30.1 
 
 		 444 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  27.85 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  32.57 
 
 		 490 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  26.15 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  26.03 
 
 		 797 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  30.51 
 
 		 436 aa  107  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  31.32 
 
 		 508 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  30.42 
 
 		 527 aa  103  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.94 
 
 		 415 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  31.92 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  31.13 
 
 		 526 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  31.08 
 
 		 527 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  32.39 
 
 		 292 aa  94.7  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  30.89 
 
 		 398 aa  94.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  30.9 
 
 		 495 aa  93.6  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  32.35 
 
 		 339 aa  93.6  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  25.46 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  25.46 
 
 		 408 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  33.98 
 
 		 292 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 		 296 aa  92  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 417 aa  91.7  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  24.87 
 
 		 406 aa  91.7  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  33.2 
 
 		 332 aa  90.5  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 415 aa  90.5  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  30.77 
 
 		 295 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.09 
 
 		 295 aa  88.6  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 		 303 aa  88.6  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  22.76 
 
 		 418 aa  88.6  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  30.77 
 
 		 341 aa  88.6  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 		 303 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 		 303 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 		 300 aa  88.6  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  32.39 
 
 		 290 aa  88.6  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.52 
 
 		 412 aa  88.2  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>