More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1886 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  100 
 
 
397 aa  789    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  40.93 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  38.82 
 
 
422 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  40.65 
 
 
411 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  39.22 
 
 
421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  41.38 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  41.38 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  41.38 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  41.38 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  36.88 
 
 
417 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  40.12 
 
 
399 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  38.31 
 
 
420 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  38.59 
 
 
398 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  37.37 
 
 
398 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  37.37 
 
 
398 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  37.98 
 
 
428 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  39.38 
 
 
565 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  39.38 
 
 
565 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  39.38 
 
 
565 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  39.38 
 
 
565 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  39.38 
 
 
563 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  36.1 
 
 
557 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  35.57 
 
 
565 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  35.57 
 
 
565 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  37.33 
 
 
559 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  36.44 
 
 
566 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  36.59 
 
 
563 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  35.77 
 
 
588 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  36.39 
 
 
580 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  34.65 
 
 
580 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  36.24 
 
 
578 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  34.65 
 
 
578 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  34.46 
 
 
566 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  34.52 
 
 
563 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  35.38 
 
 
575 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  35.98 
 
 
565 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  34.15 
 
 
559 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  34.84 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  35.93 
 
 
566 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  34.16 
 
 
578 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  35.21 
 
 
578 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  35.21 
 
 
578 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  35.39 
 
 
442 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  35.75 
 
 
559 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  29.51 
 
 
376 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  34.77 
 
 
507 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  34.77 
 
 
559 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  32.59 
 
 
710 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  33.33 
 
 
716 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  29.59 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  35.44 
 
 
609 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  27.93 
 
 
434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  27.01 
 
 
417 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  27.01 
 
 
406 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  27.73 
 
 
408 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  27.81 
 
 
408 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  32.31 
 
 
577 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  32.31 
 
 
577 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  36.94 
 
 
770 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  31.11 
 
 
733 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.47 
 
 
616 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  27.91 
 
 
624 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  28.57 
 
 
430 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  30.53 
 
 
618 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  33.43 
 
 
609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  27.2 
 
 
415 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  31.2 
 
 
398 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  28.96 
 
 
704 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  28.96 
 
 
704 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  25.75 
 
 
411 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  27.48 
 
 
444 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  30.65 
 
 
734 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  28.17 
 
 
618 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  25.49 
 
 
415 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  44.72 
 
 
222 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  31.04 
 
 
630 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  26.95 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  32.8 
 
 
191 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  35.03 
 
 
526 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  26.83 
 
 
732 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  24.58 
 
 
431 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  29.64 
 
 
508 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  24.58 
 
 
431 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  28.53 
 
 
495 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  24.58 
 
 
431 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  24.58 
 
 
431 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  28.25 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.93 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  25.65 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  24.46 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  24.34 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  23.94 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  25.8 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  42.73 
 
 
527 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  26.63 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  24.14 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  24.93 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  36.14 
 
 
185 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  38.06 
 
 
190 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  24.28 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>