More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6948 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  92.93 
 
 		 580 aa  1053    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  63.3 
 
 		 565 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  93.25 
 
 		 578 aa  1054    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  67.88 
 
 		 566 aa  723    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  65.89 
 
 		 565 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  64.87 
 
 		 563 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  66.97 
 
 		 559 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  100 
 
 		 578 aa  1137    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  65.36 
 
 		 559 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  65.89 
 
 		 565 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  65.89 
 
 		 565 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  65.89 
 
 		 565 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  67.63 
 
 		 559 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  93.08 
 
 		 578 aa  1055    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  64.27 
 
 		 565 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  64.49 
 
 		 566 aa  712    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  88.93 
 
 		 575 aa  998    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  93.08 
 
 		 578 aa  1053    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  66.03 
 
 		 566 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  64.45 
 
 		 565 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  92.91 
 
 		 578 aa  1053    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  62.5 
 
 		 559 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  66.91 
 
 		 563 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  62.5 
 
 		 563 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  61.31 
 
 		 557 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  71.88 
 
 		 442 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  62.96 
 
 		 507 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  53.94 
 
 		 580 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  53.74 
 
 		 588 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  67.53 
 
 		 248 aa  296  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  32.89 
 
 		 704 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  32.89 
 
 		 704 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  32.79 
 
 		 716 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  38.26 
 
 		 770 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  39.52 
 
 		 411 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  57.58 
 
 		 222 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  31.97 
 
 		 733 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  34.09 
 
 		 630 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  35.91 
 
 		 417 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  34.53 
 
 		 422 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  35.46 
 
 		 394 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  33.87 
 
 		 710 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  33.88 
 
 		 421 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  35.57 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  36.15 
 
 		 399 aa  189  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  57.14 
 
 		 185 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  34.28 
 
 		 398 aa  180  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  35.1 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  35.31 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  35.31 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  35.31 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  35.31 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  34.28 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  34.28 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  30.74 
 
 		 577 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  30.57 
 
 		 577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  31.17 
 
 		 618 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  36.24 
 
 		 397 aa  169  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  35.06 
 
 		 420 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 609 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  31.55 
 
 		 609 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  30.9 
 
 		 624 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  28.3 
 
 		 732 aa  143  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  29.13 
 
 		 734 aa  143  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 618 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  29.12 
 
 		 376 aa  127  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  37.82 
 
 		 616 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  31.19 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  30.18 
 
 		 797 aa  120  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  28.32 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  33.06 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  27.05 
 
 		 444 aa  111  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  33.23 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  32.12 
 
 		 526 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  28.69 
 
 		 527 aa  103  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  24.8 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  25.59 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  30.5 
 
 		 490 aa  97.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  26.67 
 
 		 408 aa  96.3  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  26.67 
 
 		 408 aa  95.5  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  27.35 
 
 		 415 aa  94  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  26.17 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  30.08 
 
 		 508 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.47 
 
 		 296 aa  91.3  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  29.07 
 
 		 495 aa  91.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  23.1 
 
 		 418 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  30.08 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.6 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  29.13 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 317 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  34.32 
 
 		 315 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  33.15 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  28.99 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  34.27 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  29.35 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  36.53 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.74 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1679  phage integrase  68.52 
 
 		 54 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.493771  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  29.81 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>