163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_A0040 on replicon NC_009726
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  99.75 
 
 		 406 aa  838    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  100 
 
 		 417 aa  865    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  61.04 
 
 		 408 aa  508  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  60.79 
 
 		 408 aa  505  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  49.88 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  37.77 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  34.12 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  35.41 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  35.19 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  35.21 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  36.87 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  34.74 
 
 		 431 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.33 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  34.51 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  34.51 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  32.51 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  36 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  34.11 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  34.11 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  34.35 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  33.1 
 
 		 430 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  31.12 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  33.95 
 
 		 440 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  28.84 
 
 		 411 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  31.17 
 
 		 418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  37.28 
 
 		 288 aa  176  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  29.6 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.78 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  29.49 
 
 		 421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  28.19 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  28.95 
 
 		 420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  30.91 
 
 		 397 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  30.91 
 
 		 397 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  30.91 
 
 		 397 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  30.91 
 
 		 397 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  28.99 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  28.74 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  28.5 
 
 		 398 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  28.5 
 
 		 398 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  28.16 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  29.07 
 
 		 417 aa  131  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  27.01 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  26.72 
 
 		 716 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 566 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 559 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 565 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  26.7 
 
 		 563 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  25.33 
 
 		 578 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  24.88 
 
 		 557 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  25.66 
 
 		 588 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  27.57 
 
 		 733 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  25.35 
 
 		 563 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  24.64 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  25.93 
 
 		 575 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  25.65 
 
 		 559 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  24.87 
 
 		 565 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 565 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  25.85 
 
 		 566 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  25.65 
 
 		 578 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 578 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  25.55 
 
 		 580 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  25.65 
 
 		 563 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  25.26 
 
 		 578 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  23.79 
 
 		 559 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  25 
 
 		 578 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  25 
 
 		 580 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  26.45 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  24.66 
 
 		 704 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  24.66 
 
 		 704 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 565 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  26.54 
 
 		 770 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  26.4 
 
 		 566 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  24.27 
 
 		 630 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  23.83 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  26.02 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 559 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  23.92 
 
 		 624 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  22.14 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 609 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  23.5 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  23.1 
 
 		 732 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 191 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2367  hypothetical protein  33.86 
 
 		 146 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  22.55 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  22.85 
 
 		 734 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  23.61 
 
 		 495 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  22.77 
 
 		 797 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  21.22 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  23.43 
 
 		 618 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1318  integrase/recombinase protein  32.64 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  22.22 
 
 		 527 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  23.39 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>