109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0076 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  100 
 
 		 797 aa  1605    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  27.81 
 
 		 704 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  27.81 
 
 		 704 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  29.05 
 
 		 732 aa  195  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  28.99 
 
 		 733 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  26.83 
 
 		 734 aa  191  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  30.61 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  28.13 
 
 		 716 aa  180  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  28.84 
 
 		 578 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  28.62 
 
 		 578 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 578 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  30.69 
 
 		 411 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  27.62 
 
 		 630 aa  140  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  30.62 
 
 		 421 aa  138  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  29.29 
 
 		 420 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 618 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  29.54 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  29.54 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  29.54 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  29.34 
 
 		 397 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  29.34 
 
 		 397 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  29.34 
 
 		 397 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  29.34 
 
 		 397 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  30.52 
 
 		 770 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  35.19 
 
 		 428 aa  124  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  27.45 
 
 		 563 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  33.46 
 
 		 422 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  35 
 
 		 399 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  30 
 
 		 578 aa  119  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 578 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  25.65 
 
 		 394 aa  119  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  28.97 
 
 		 616 aa  118  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  30.51 
 
 		 580 aa  118  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  29.52 
 
 		 563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 566 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  29.31 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 563 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  29.41 
 
 		 575 aa  110  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 565 aa  108  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 559 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  29.4 
 
 		 566 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  31.49 
 
 		 559 aa  105  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  29.04 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  32.61 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  29.04 
 
 		 507 aa  102  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  32.12 
 
 		 557 aa  101  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  26.79 
 
 		 565 aa  98.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 565 aa  98.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  26.59 
 
 		 559 aa  95.9  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  29.4 
 
 		 580 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  27.43 
 
 		 566 aa  93.2  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  28 
 
 		 442 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  30.16 
 
 		 577 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  30.16 
 
 		 577 aa  84.7  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  26.71 
 
 		 588 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 624 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  28.73 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  26.52 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  31.25 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  26.48 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  24.45 
 
 		 408 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  24.45 
 
 		 408 aa  66.6  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  22.77 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  22.77 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  21.62 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  24.41 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  27.13 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  25.85 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  29.66 
 
 		 398 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  34.74 
 
 		 609 aa  55.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  20.8 
 
 		 412 aa  52.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3359  phage integrase family protein  25 
 
 		 191 aa  52  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.843905  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  25 
 
 		 490 aa  52.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  21.48 
 
 		 415 aa  51.6  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  21.28 
 
 		 434 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  23.77 
 
 		 304 aa  49.3  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02236  putative prolin-rich protein  33 
 
 		 432 aa  48.5  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  33.61 
 
 		 185 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  41.82 
 
 		 436 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  40 
 
 		 436 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0232  integrase/recombinase, putative  46.51 
 
 		 347 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000342454  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0182  integrase/recombinase  46.51 
 
 		 317 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44216  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  37.33 
 
 		 317 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 408 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0189  integrase/recombinase, putative  46.51 
 
 		 347 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122412  hitchhiker  3.7857800000000004e-44 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  34.52 
 
 		 301 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  39.66 
 
 		 326 aa  47  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  41.3 
 
 		 411 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1797  phage integrase  32.95 
 
 		 303 aa  45.8  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  35.37 
 
 		 295 aa  45.8  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  28.16 
 
 		 302 aa  45.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  32.95 
 
 		 495 aa  45.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  34.74 
 
 		 315 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>