More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4932 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  100 
 
 		 618 aa  1239    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  55.38 
 
 		 616 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  40.83 
 
 		 618 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  35.38 
 
 		 577 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  35.06 
 
 		 577 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  31 
 
 		 704 aa  196  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  31 
 
 		 704 aa  196  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  32.1 
 
 		 716 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  30.06 
 
 		 630 aa  173  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  31.91 
 
 		 609 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  31.18 
 
 		 563 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  30.47 
 
 		 559 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 566 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  27.52 
 
 		 734 aa  157  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  30.33 
 
 		 565 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  30.33 
 
 		 565 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  30.33 
 
 		 565 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  30.33 
 
 		 565 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  30.95 
 
 		 580 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  30.71 
 
 		 563 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  26.92 
 
 		 732 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 624 aa  150  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 559 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  31.18 
 
 		 421 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 565 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  29.69 
 
 		 565 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  27.95 
 
 		 797 aa  144  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 565 aa  144  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  30 
 
 		 559 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  29.79 
 
 		 770 aa  144  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  30.07 
 
 		 710 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  29.65 
 
 		 507 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  29.73 
 
 		 588 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 559 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  29.16 
 
 		 580 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  29.78 
 
 		 578 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  29.4 
 
 		 422 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  29.46 
 
 		 578 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  28.49 
 
 		 563 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.73 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  31.49 
 
 		 609 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  29.78 
 
 		 578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  30.17 
 
 		 575 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 578 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  30.23 
 
 		 578 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  32.78 
 
 		 428 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  29 
 
 		 442 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  30.37 
 
 		 398 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  30.37 
 
 		 398 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  30.37 
 
 		 398 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  28.93 
 
 		 557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  28.54 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  30.86 
 
 		 420 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  27.31 
 
 		 733 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  28.17 
 
 		 394 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  36.59 
 
 		 222 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  28.6 
 
 		 566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  27.44 
 
 		 526 aa  117  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  28.44 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  30.51 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  28.17 
 
 		 397 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  29.73 
 
 		 397 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  29.73 
 
 		 397 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  29.73 
 
 		 397 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  29.73 
 
 		 397 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  28.61 
 
 		 527 aa  97.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  31.42 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  28.26 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  28.31 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  29.03 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  27.25 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  29.14 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  28.54 
 
 		 495 aa  73.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  24.74 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  28.64 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19700  site-specific recombinase XerD  25.97 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0129569 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  22.55 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  23.57 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  23.63 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  24.53 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  25.06 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  24.27 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  24.07 
 
 		 309 aa  56.6  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  21.91 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  22.64 
 
 		 295 aa  56.2  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  27.05 
 
 		 317 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7607  phage integrase family protein  29.67 
 
 		 248 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.484677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  33.53 
 
 		 468 aa  55.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  26.64 
 
 		 292 aa  54.7  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 315 aa  55.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.06 
 
 		 296 aa  54.3  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.67 
 
 		 296 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.67 
 
 		 296 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.67 
 
 		 296 aa  53.9  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.67 
 
 		 296 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  25.69 
 
 		 295 aa  54.3  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.67 
 
 		 296 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.37 
 
 		 296 aa  53.9  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 278 aa  53.9  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>