68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5345 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  100 
 
 		 527 aa  1049    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  51.39 
 
 		 526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  33.27 
 
 		 577 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  33.46 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  31.55 
 
 		 618 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  31.24 
 
 		 578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  31.59 
 
 		 578 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  31.38 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  31.17 
 
 		 578 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  28.19 
 
 		 559 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  30.82 
 
 		 580 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  30.67 
 
 		 578 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  31 
 
 		 588 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  31.02 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  30.17 
 
 		 575 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  30.18 
 
 		 563 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  28.21 
 
 		 563 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 565 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  31.31 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  32.89 
 
 		 710 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  30.96 
 
 		 630 aa  100  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  31.1 
 
 		 557 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  34.35 
 
 		 733 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 559 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  31.08 
 
 		 565 aa  97.4  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 618 aa  97.4  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 566 aa  97.1  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  32.92 
 
 		 566 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  30.22 
 
 		 563 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  31.83 
 
 		 559 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  32.09 
 
 		 566 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  26.39 
 
 		 616 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 559 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  28.77 
 
 		 507 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  36.98 
 
 		 222 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  35.41 
 
 		 398 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  35.41 
 
 		 398 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  35.41 
 
 		 398 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  35.41 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  27.26 
 
 		 704 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  27.26 
 
 		 704 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  35.55 
 
 		 770 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  43.97 
 
 		 428 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  42.73 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 609 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  37.93 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  29.52 
 
 		 716 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  41.59 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  28.37 
 
 		 732 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  28.85 
 
 		 624 aa  73.6  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  33.94 
 
 		 417 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  26.1 
 
 		 734 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  39.45 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  31.37 
 
 		 442 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  38.6 
 
 		 394 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  34.19 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  39.47 
 
 		 420 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  34.57 
 
 		 399 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  32.48 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  32.48 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  32.48 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  32.48 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  25.85 
 
 		 797 aa  60.5  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  24.8 
 
 		 609 aa  60.1  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>