More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5516 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  83.38 
 
 		 732 aa  1198    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  100 
 
 		 734 aa  1499    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  29.22 
 
 		 716 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  28.13 
 
 		 704 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  28.13 
 
 		 704 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0076  hypothetical protein  26.83 
 
 		 797 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.701551  hitchhiker  0.00833618 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  29.95 
 
 		 733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  29.91 
 
 		 630 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 565 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 565 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 565 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  30.32 
 
 		 770 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  30.56 
 
 		 565 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  31.02 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  31.48 
 
 		 559 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6577  integrase family protein  27.26 
 
 		 710 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00328143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4932  phage integrase family protein  27.52 
 
 		 618 aa  157  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.356622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  31.07 
 
 		 588 aa  154  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  29.85 
 
 		 566 aa  154  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  28.99 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  28.88 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  28.88 
 
 		 565 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6164  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.78 
 
 		 616 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 565 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  30.71 
 
 		 580 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  29.06 
 
 		 580 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  30.74 
 
 		 578 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  29.23 
 
 		 566 aa  147  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  30.32 
 
 		 578 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  30.57 
 
 		 578 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  29.58 
 
 		 575 aa  142  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  31.74 
 
 		 559 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  30.1 
 
 		 422 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  29.33 
 
 		 559 aa  141  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  29.03 
 
 		 578 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  28.1 
 
 		 557 aa  140  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  32.36 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  27.41 
 
 		 563 aa  134  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  29.51 
 
 		 411 aa  134  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6892  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 618 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  29.6 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  29.76 
 
 		 421 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  29.28 
 
 		 420 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  26.84 
 
 		 394 aa  128  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 559 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  29.1 
 
 		 398 aa  127  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  28.57 
 
 		 507 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  28.86 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  28.86 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  30.92 
 
 		 566 aa  124  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  30.55 
 
 		 399 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  28.78 
 
 		 397 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  28.78 
 
 		 397 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  28.78 
 
 		 397 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  28.78 
 
 		 397 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4952  integrase family protein  28.63 
 
 		 577 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  26.73 
 
 		 417 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4473  phage integrase family protein  25 
 
 		 609 aa  113  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00130209  decreased coverage  4.4515899999999994e-20 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5448  integrase family protein  28.44 
 
 		 577 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4251  phage integrase family protein  23.44 
 
 		 624 aa  108  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4691  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 609 aa  107  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298565  normal  0.0454355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  30.65 
 
 		 397 aa  105  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4175  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 436 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  28.16 
 
 		 527 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  25.98 
 
 		 420 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7315  integrase family protein  27.75 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968074  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  27.81 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5988  tyrosine-based site-specific recombinase BimA  27.37 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239926  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4613  integrase domain-containing protein  38.04 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.754834 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  27.51 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  25.13 
 
 		 376 aa  76.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5345  putative integrase/recombinase protein  26.45 
 
 		 527 aa  72  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  23.13 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  26.63 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  23.96 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  23.9 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  22.85 
 
 		 417 aa  67  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  22.85 
 
 		 406 aa  66.6  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4967  integrase family protein  28.37 
 
 		 495 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.617968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  25.27 
 
 		 308 aa  62  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  31.12 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5821  tyrosine-based site-specific recombinase XerD  24 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  28.97 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  23.66 
 
 		 413 aa  60.1  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4624  integrase family protein  27.96 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.00236939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.82 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0409  Phage integrase  32.55 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.383536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  30.29 
 
 		 313 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  23.83 
 
 		 434 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  28.3 
 
 		 294 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  26.15 
 
 		 318 aa  56.2  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  21.78 
 
 		 415 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.31 
 
 		 294 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 306 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 306 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  23.89 
 
 		 301 aa  55.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 306 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  20.75 
 
 		 418 aa  55.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>