170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2429 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2210  integrase family protein  71.23 
 
 		 431 aa  657    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241483  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2002  phage integrase family protein  72.33 
 
 		 431 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0997607  hitchhiker  0.000000242196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1973  phage integrase family protein  72.09 
 
 		 431 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.218388  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2104  phage integrase family protein  72.39 
 
 		 431 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896145  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4483  hypothetical protein  70.53 
 
 		 431 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2197  phage integrase family protein  70.53 
 
 		 431 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2429  integrase family protein  100 
 
 		 430 aa  901    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2174  phage integrase family protein  71 
 
 		 431 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2207  phage integrase family protein  83.72 
 
 		 430 aa  743    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2211  integrase family protein  71.16 
 
 		 430 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0136042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2224  phage integrase family protein  71.46 
 
 		 431 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0802491  normal  0.324661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2007  phage integrase family protein  67.06 
 
 		 435 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000769024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1982  phage integrase family protein  64.94 
 
 		 423 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0235719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1855  phage integrase  66.2 
 
 		 440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2370  phage integrase family site specific recombinase  76.04 
 
 		 288 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2111  phage integrase  37.22 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0002  phage integrase family site specific recombinase  33.18 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.952684  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0040  phage integrase family protein  33.1 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2082  phage integrase family protein  35.49 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.267765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2367  hypothetical protein  62.5 
 
 		 146 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1832  hypothetical protein  30.42 
 
 		 408 aa  204  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1829  hypothetical protein  29.95 
 
 		 408 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25680  Phage integrase  30.88 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2857  site-specific recombinase, phage integrase family  29.34 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0775939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1968  phage integrase family site specific recombinase  30 
 
 		 415 aa  159  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.172186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02040  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.5 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.751344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2629  phage integrase family site specific recombinase  28 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4242  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2856  site-specific recombinase, phage integrase family  25.77 
 
 		 434 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2135  integrase family protein  27.18 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182439  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4335  integrase family protein  25.34 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199412 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4445  integrase family protein  25.34 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0199847  normal  0.157682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1733  integrase family protein  25.34 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.461971 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5048  integrase family protein  25.34 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  26.3 
 
 		 716 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1625  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.45 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  24.67 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1886  phage integrase family protein  24.75 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.455882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3895  phage integrase  24.06 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2034  integrase family protein  25 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  hitchhiker  0.0000000170998 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4473  phage integrase family protein  24.06 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5830  integrase family protein  23.8 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00308669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4162  integrase family protein  23.8 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1405  Phage integrase  23.34 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  24.48 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2777  integrase family protein  22.02 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0260202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  22.8 
 
 		 630 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6320  tyrosine-based site-specific recombinase activity site-specific DNA integration  26.57 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4328  phage integrase  26.39 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0092  putative integrase family protein  24.74 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.967916  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  21.2 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  21.2 
 
 		 704 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1886  phage integrase  23.87 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.031072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  22.95 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  24.53 
 
 		 563 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6262  integrase family protein  23.68 
 
 		 770 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  23 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  24.46 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  25.65 
 
 		 557 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  25.08 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  25 
 
 		 578 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.13 
 
 		 308 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  22.93 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5076  integrase family protein  23.83 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.821689  normal  0.0349063 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  22.18 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  24.68 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  24.68 
 
 		 578 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  26.28 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  24.72 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  24.1 
 
 		 575 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  25.28 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  25.48 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  22.39 
 
 		 290 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  24.76 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  24.43 
 
 		 578 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  24.76 
 
 		 578 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5548  phage integrase  22.69 
 
 		 527 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174978  normal  0.321363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  27.08 
 
 		 326 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  24.72 
 
 		 294 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  24.44 
 
 		 293 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6193  phage integrase-like SAM-like  22.25 
 
 		 495 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126905  hitchhiker  0.000249234 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 563 aa  53.5  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  23.91 
 
 		 298 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4624  integrase family protein  23.93 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.00236939 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.16 
 
 		 307 aa  53.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  22.04 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  27.27 
 
 		 289 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5664  integrase family protein  22.5 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.375823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  23.13 
 
 		 563 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  24.5 
 
 		 559 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>