More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4624 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4624  integrase family protein  100 
 
 		 353 aa  690    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.00236939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19700  site-specific recombinase XerD  51.25 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0129569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1744  integrase family protein  41.24 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2384  integrase family protein  38.36 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1780  integrase family protein  37.71 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4446  Site-specific recombinase XerD-like protein  32.91 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000279305  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 296 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 296 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.73 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  28.33 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.35 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 		 296 aa  106  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 		 296 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.83 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.06 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.08 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  38.65 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  34.3 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.82 
 
 		 295 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.68 
 
 		 330 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.32 
 
 		 298 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  31.69 
 
 		 298 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  31.84 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.1 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.77 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.04 
 
 		 300 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 299 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  34.76 
 
 		 292 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  34.58 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  35.08 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  32.2 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  27.19 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.7 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  38.51 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  30.86 
 
 		 295 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.91 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  35.62 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.91 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.91 
 
 		 300 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  33.52 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  32.02 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.3 
 
 		 298 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  32.45 
 
 		 342 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25.08 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.97 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.44 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.02 
 
 		 450 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  29.69 
 
 		 293 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.44 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.95 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  26.4 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  32.92 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  29.8 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  30 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.02 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.44 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  31.62 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.04 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  29.84 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0737  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.56 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.088128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.66 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.19 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.03 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.03 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  33.21 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.03 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  32.51 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  32.19 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  31.29 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  36.46 
 
 		 344 aa  89.7  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  29.25 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.6 
 
 		 322 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  32.77 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  28.98 
 
 		 309 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 298 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  37.61 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  29.27 
 
 		 291 aa  89.7  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 322 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.03 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  31.76 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.75 
 
 		 309 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.6 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.64 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.13 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.16 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  25.83 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  31.6 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>