More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19700  site-specific recombinase XerD  100 
 
 		 354 aa  700    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0129569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4624  integrase family protein  51.25 
 
 		 353 aa  322  9.000000000000001e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.00236939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1744  integrase family protein  35.36 
 
 		 362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1780  integrase family protein  32.6 
 
 		 364 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2384  integrase family protein  33.71 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 317 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.3 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.15 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.61 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4446  Site-specific recombinase XerD-like protein  29.21 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000279305  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  33.23 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.87 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  30.52 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  30.43 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.91 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  32.64 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  31.71 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  35.8 
 
 		 332 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.22 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  27.73 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  32.32 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  30.61 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  30.19 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  30.9 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  29.79 
 
 		 307 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  27.54 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 295 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  31.66 
 
 		 293 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  28.8 
 
 		 299 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  30.06 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  34.04 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  29.71 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  29.51 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  29.17 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.72 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  28.48 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  29.38 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.6 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  31.31 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.86 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.72 
 
 		 303 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  33.33 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.86 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  31.54 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.27 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  32.37 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  29.54 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  31.12 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  30.56 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  34.41 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  30.03 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.48 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.47 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.25 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.77 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.07 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.83 
 
 		 315 aa  107  5e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.71 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.32 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.3 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.78 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  32.08 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.76 
 
 		 450 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  26.47 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  35.98 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.9 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.73 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  26.75 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.82 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  33.77 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  28.93 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.91 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.05 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.05 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  29.8 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.05 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  29.96 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  30.19 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  32.64 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  32 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.05 
 
 		 300 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  26.67 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>