More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09270 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  100 
 
 
346 aa  660    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  54.18 
 
 
295 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  54.69 
 
 
308 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.63 
 
 
300 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.63 
 
 
300 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  52.94 
 
 
300 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  51.24 
 
 
329 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  53.25 
 
 
300 aa  278  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.98 
 
 
319 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  50.15 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  53.87 
 
 
304 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  50.94 
 
 
312 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.38 
 
 
298 aa  255  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.35 
 
 
303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  50.61 
 
 
325 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  51.85 
 
 
325 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  49.14 
 
 
380 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  52.32 
 
 
289 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  48.3 
 
 
317 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  52.8 
 
 
308 aa  246  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  50.77 
 
 
298 aa  245  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  47.67 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  47.62 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  48.7 
 
 
336 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  46.11 
 
 
336 aa  239  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  52.01 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.35 
 
 
355 aa  239  5.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  45.92 
 
 
336 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  42.34 
 
 
333 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  46.99 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  37.77 
 
 
298 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  47.06 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  39.25 
 
 
302 aa  212  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  39.14 
 
 
305 aa  212  9e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  36.84 
 
 
307 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  36.84 
 
 
307 aa  209  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  36.84 
 
 
307 aa  208  9e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  37.8 
 
 
301 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  41.46 
 
 
293 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  42.39 
 
 
317 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.38 
 
 
300 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  42.41 
 
 
290 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  46.85 
 
 
363 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  41.72 
 
 
313 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  35 
 
 
295 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  41.46 
 
 
293 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  41.98 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.92 
 
 
299 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.62 
 
 
299 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.23 
 
 
299 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  39.81 
 
 
298 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.31 
 
 
299 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.92 
 
 
299 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.92 
 
 
299 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.92 
 
 
299 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  41.9 
 
 
302 aa  198  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.92 
 
 
299 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.92 
 
 
299 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.62 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.92 
 
 
301 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  37.73 
 
 
294 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  37.54 
 
 
323 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.23 
 
 
298 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  32.72 
 
 
300 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  39.76 
 
 
294 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.98 
 
 
296 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.62 
 
 
299 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  40.79 
 
 
346 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.67 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.67 
 
 
296 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
296 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.91 
 
 
296 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  36.96 
 
 
308 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  44.79 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  42.94 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  40.62 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  48.76 
 
 
329 aa  190  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.98 
 
 
314 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 
318 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  39.21 
 
 
308 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.9 
 
 
318 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  43.43 
 
 
313 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.32 
 
 
296 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  33.94 
 
 
338 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  39.88 
 
 
302 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.72 
 
 
317 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.59 
 
 
318 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  32.75 
 
 
337 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  36.34 
 
 
304 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  37 
 
 
296 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  39.51 
 
 
294 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  39.82 
 
 
298 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  40.46 
 
 
362 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  35.06 
 
 
319 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  41.87 
 
 
315 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>