37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1679 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1679  phage integrase  100 
 
 		 54 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.493771  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  68.52 
 
 		 566 aa  80.1  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7054  integrase family protein  68.52 
 
 		 578 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  68.52 
 
 		 578 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  68.52 
 
 		 578 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6458  integrase family protein  68.52 
 
 		 580 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.446342 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4706  integrase family protein  68.52 
 
 		 563 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6948  Phage integrase  68.52 
 
 		 578 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00529901  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5705  phage integrase family protein  68.52 
 
 		 578 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.782513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1051  phage integrase family protein  70.37 
 
 		 565 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.930281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1208  phage integrase family protein  70.37 
 
 		 565 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0376  phage integrase family protein  70.37 
 
 		 565 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0038  phage integrase family protein  70.37 
 
 		 565 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1825  integrase family protein  67.92 
 
 		 566 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0271537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  66.67 
 
 		 575 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6864  phage integrase family protein  70.37 
 
 		 563 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728791  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01673  putative integrase/recombinase protein  67.92 
 
 		 566 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1746  integrase family protein  69.23 
 
 		 442 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  68 
 
 		 563 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4514  Tyrosine-based site-specific recombinase  66 
 
 		 559 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197712  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5529  phage integrase  67.92 
 
 		 557 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95616 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2103  phage integrase family protein  70 
 
 		 559 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1740  integrase family protein  63.46 
 
 		 559 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407368 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  62.26 
 
 		 565 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  62.26 
 
 		 565 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6926  integrase family protein  64 
 
 		 580 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1227  phage integrase  57.41 
 
 		 507 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6605  phage integrase family protein  57.41 
 
 		 559 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  64 
 
 		 588 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4614  phage integrase  60 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  56.6 
 
 		 565 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1507  integrase family protein  44.68 
 
 		 704 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.879594  normal  0.107383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5172  integrase family protein  44.68 
 
 		 704 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7324  integrase family protein  60 
 
 		 421 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0511421 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6086  tyrosine-based site-specific recombinase  44 
 
 		 716 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0503413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6112  integrase family protein  43.4 
 
 		 630 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5789  integrase family protein  47.17 
 
 		 399 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>