More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0849 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0849  integrase family protein  100 
 
 		 380 aa  758    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.607856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0044  integrase family protein  44.88 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.381266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0860  phage integrase family protein  43.66 
 
 		 337 aa  235  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  31.6 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  39.27 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.25 
 
 		 346 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.13 
 
 		 318 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.81 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  35.39 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.81 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  30.06 
 
 		 318 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  37.04 
 
 		 324 aa  86.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.7 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  28.75 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  28.75 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  28.75 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  28.75 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.91 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  31.56 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.53 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  24.38 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  35.23 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  34.34 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  36.26 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  35.11 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  29.73 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  36.81 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  35.03 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  30.56 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.27 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.84 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  35.59 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  35.59 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.36 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  33.92 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.48 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  31.38 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  30.73 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.87 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.54 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.89 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  24.61 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  33.71 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4983  Phage integrase  27.58 
 
 		 588 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 		 301 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  25.53 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  30.06 
 
 		 314 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.07 
 
 		 324 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  34.43 
 
 		 311 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  34.78 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  34.2 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  28.21 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  35.96 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.97 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  34.64 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.9 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  35.09 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  32.95 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  33.15 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.76 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  27.63 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  33.13 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  29.78 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  33.15 
 
 		 565 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.52 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  32.52 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  28.02 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.4 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  34.57 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  26.59 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  31.3 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.08 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>