More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0044 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0044  integrase family protein  100 
 
 		 337 aa  683    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.381266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0860  phage integrase family protein  81.85 
 
 		 337 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0849  integrase family protein  44.88 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.607856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.83 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  35.14 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.76 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.29 
 
 		 296 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.76 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.76 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.76 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.76 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  35.64 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  35.14 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  32.13 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  33.54 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  35.33 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  28.06 
 
 		 306 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.21 
 
 		 299 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  32.07 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  34.78 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  29.71 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  27.8 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  35.52 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  35.16 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  35.48 
 
 		 296 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  34.94 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  28.79 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  34.01 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  33.51 
 
 		 292 aa  86.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  38.42 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  33.7 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  30.67 
 
 		 298 aa  86.3  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.76 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.4 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.4 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.4 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.4 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  35.71 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.4 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  27.48 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  24.28 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  29.6 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  33.16 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  35.98 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  36.9 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  28.95 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  35.16 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  33.88 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  31.6 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  34.52 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  34.57 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  32.97 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  37.72 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.71 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  37.97 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  34.24 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.52 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  33.16 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  32.97 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  36.02 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  27.53 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  30.11 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  31.89 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  31.56 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  28.87 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  31.74 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  30.85 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.55 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  36.99 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  32.97 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  27.02 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  33.51 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  37.84 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  35.78 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.17 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  33.67 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  27.3 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  31.02 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  32.97 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>